More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2683 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 
425 aa  871    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 
424 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
419 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
424 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 
419 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
418 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
418 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
418 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
418 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
418 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
418 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
418 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
418 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
418 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
418 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
425 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
418 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 
421 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
420 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
424 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  48.94 
 
 
424 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1784  tyrosyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
420 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
421 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
424 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2362  tyrosyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
422 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.587755  decreased coverage  0.00168263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
424 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
424 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
424 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
424 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1819  tyrosyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
420 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
424 aa  411  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
424 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
424 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
424 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  49.41 
 
 
422 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
447 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
424 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
424 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
424 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
424 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
424 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
424 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 
424 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
424 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5211  tyrosyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
424 aa  408  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  decreased coverage  0.000321192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4898  tyrosyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5215  tyrosyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4936  tyrosyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
419 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4797  tyrosyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
419 aa  405  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5228  tyrosyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
419 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5314  tyrosyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
419 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5445  tyrosyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
427 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5179  tyrosyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
419 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.731963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2831  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 
437 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4777  tyrosyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
419 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0033  tyrosyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
420 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11705  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.316613 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
431 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0855  tyrosyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00588538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
424 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
432 aa  396  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1507  tyrosyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
427 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0498725  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3513  tyrosyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 
425 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3294  tyrosyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
424 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354636  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
419 aa  393  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1564  tyrosyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
425 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
430 aa  390  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1336  tyrosyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
419 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.556286  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25540  tyrosyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
424 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
424 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1652  tyrosyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
427 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
431 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1511  tyrosyl-tRNA synthetase  48 
 
 
437 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000132583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
420 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1254  tyrosyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
426 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.166593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1905  tyrosyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
428 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13251  normal  0.168807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2955  tyrosyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
423 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2970  tyrosyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
423 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal  0.024912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2999  tyrosyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
423 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4122  tyrosyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
450 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00834024  hitchhiker  0.0000528667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5462  tyrosyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
420 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0022197  hitchhiker  0.00568938 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
426 aa  383  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101088 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
418 aa  382  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1171  tyrosyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
420 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757017  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0921  tyrosyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
423 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0622234  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1896  tyrosyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
428 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1100  tyrosyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
420 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1071  tyrosyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 
448 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000119232  hitchhiker  0.000872394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1120  tyrosyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
422 aa  381  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0158  tyrosyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
419 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0103805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1044  tyrosyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
420 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
432 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
422 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0169974  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06520  tyrosyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
418 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1512  tyrosyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
437 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.675867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
428 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000651  tyrosyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
419 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>