More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0714 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  82.06 
 
 		 419 aa  724    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 419 aa  858    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  70.81 
 
 		 418 aa  636    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  70.33 
 
 		 418 aa  631  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 418 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 418 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 418 aa  632  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 418 aa  632  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 418 aa  632  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 418 aa  633  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 418 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  70.1 
 
 		 418 aa  631  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 418 aa  633  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 420 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1819  tyrosyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 420 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1784  tyrosyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 		 420 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 421 aa  528  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5211  tyrosyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 419 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4777  tyrosyl-tRNA synthetase  59.09 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4936  tyrosyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4797  tyrosyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 419 aa  528  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5179  tyrosyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.731963 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5314  tyrosyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5228  tyrosyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 419 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4898  tyrosyl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 420 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0033  tyrosyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 420 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5215  tyrosyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 420 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0158  tyrosyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0103805  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 426 aa  491  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101088 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 418 aa  489  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 424 aa  485  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  56.77 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 424 aa  474  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0148  tyrosyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 416 aa  475  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000162194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 424 aa  474  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0921  tyrosyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 423 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0622234  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0855  tyrosyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 426 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00588538  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 424 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 447 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 425 aa  459  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 425 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  decreased coverage  0.000321192 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1815  tyrosyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 425 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1071  tyrosyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 448 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000119232  hitchhiker  0.000872394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1088  tyrosyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.200739 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06520  tyrosyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  52.06 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0017  tyrosyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1896  tyrosyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0081  tyrosyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1905  tyrosyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13251  normal  0.168807 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000651  tyrosyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 419 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1652  tyrosyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 427 aa  418  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2044  tyrosyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 415 aa  421  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1254  tyrosyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.166593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1336  tyrosyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.556286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 420 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1979  tyrosyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2362  tyrosyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.587755  decreased coverage  0.00168263 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1120  tyrosyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5445  tyrosyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0639  tyrosyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.529761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1511  tyrosyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000132583 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 428 aa  401  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0169974  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl587  tyrosyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 413 aa  399  9.999999999999999e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000761752  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3294  tyrosyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0587  hypothetical protein  48.25 
 
 		 427 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2831  tyrosyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1536  tyrosyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280779  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1512  tyrosyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.675867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5462  tyrosyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 420 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0022197  hitchhiker  0.00568938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4446  tyrosyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 416 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  0.300449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3297  tyrosyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1102  tyrosyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000172362  normal  0.328183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>