More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2987 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  99.29 
 
 		 423 aa  862    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  74.04 
 
 		 417 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  77.7 
 
 		 426 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  73.01 
 
 		 418 aa  635    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1870  tyrosyl-tRNA synthetase  79.38 
 
 		 424 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  868    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  75.42 
 
 		 418 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  74.28 
 
 		 418 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  74.76 
 
 		 418 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2760  tyrosyl-tRNA synthetase  85.58 
 
 		 423 aa  735    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0242462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  96.69 
 
 		 423 aa  827    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  69.47 
 
 		 418 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  70.24 
 
 		 421 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1616  tyrosyl-tRNA synthetase  70.41 
 
 		 419 aa  599  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3960  tyrosyl-tRNA synthetase  69.81 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  67.3 
 
 		 416 aa  569  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 417 aa  558  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 418 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  65.54 
 
 		 416 aa  549  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  62.8 
 
 		 417 aa  549  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  61.26 
 
 		 418 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  61.3 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 417 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  62.98 
 
 		 418 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  63.29 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  62.2 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 416 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  58.75 
 
 		 416 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 416 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 414 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1308  tyrosyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 		 415 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.589985  normal  0.597728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1649  tyrosyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0055  tyrosyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 418 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1513  tyrosyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 		 420 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.958797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0091  tyrosyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 418 aa  441  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0698214  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27323  predicted protein  51.45 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10420  tyrosyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 412 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2100  tyrosyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 409 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0674945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0952  tyrosyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0345  tyrosyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 391 aa  375  1e-102  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.388685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 408 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 406 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 406 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 435 aa  352  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 405 aa  318  9e-86  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1514  tyrosyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 416 aa  317  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  39.86 
 
 		 424 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 424 aa  306  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 424 aa  299  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  decreased coverage  0.000321192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  40.48 
 
 		 422 aa  299  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 425 aa  299  8e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1784  tyrosyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1819  tyrosyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1536  tyrosyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 427 aa  295  7e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.280779  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 447 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 430 aa  293  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 428 aa  293  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 419 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0081  tyrosyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>