More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2577 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 435 aa  895    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 433 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 408 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 406 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 410 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 406 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 418 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 418 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2760  tyrosyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0242462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 413 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3960  tyrosyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 417 aa  362  8e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 417 aa  362  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1616  tyrosyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  361  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27323  predicted protein  45.5 
 
 		 488 aa  356  3.9999999999999996e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 417 aa  352  7e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 414 aa  352  8e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2100  tyrosyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 409 aa  348  8e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0674945  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0055  tyrosyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1870  tyrosyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 424 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1513  tyrosyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.958797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1514  tyrosyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 405 aa  347  3e-94  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 416 aa  345  8e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1649  tyrosyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 422 aa  345  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 447 aa  343  4e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 418 aa  343  4e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0091  tyrosyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0698214  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 421 aa  339  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 432 aa  339  5e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 419 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 416 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 420 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 425 aa  336  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1308  tyrosyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.589985  normal  0.597728 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0158  tyrosyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 419 aa  333  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0103805  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 416 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 418 aa  332  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 419 aa  333  5e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 418 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 418 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 418 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 416 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  42.69 
 
 		 422 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 418 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 418 aa  330  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10420  tyrosyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 412 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1507  tyrosyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 427 aa  329  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0498725  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 418 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 418 aa  328  8e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 418 aa  328  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 418 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 418 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0952  tyrosyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1564  tyrosyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 425 aa  327  3e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1120  tyrosyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 422 aa  326  5e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25540  tyrosyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 424 aa  325  7e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2831  tyrosyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1044  tyrosyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1171  tyrosyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 420 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.757017  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1100  tyrosyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 421 aa  323  5e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4446  tyrosyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 416 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  0.300449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1254  tyrosyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.166593 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 425 aa  319  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 422 aa  318  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0169974  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 430 aa  318  9e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>