More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1463 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  67.47 
 
 		 600 aa  821    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 598 aa  1233    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  55.89 
 
 		 586 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  52.74 
 
 		 598 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  50.86 
 
 		 598 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  50.43 
 
 		 597 aa  586  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  48.38 
 
 		 584 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  48.29 
 
 		 585 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  48.7 
 
 		 619 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  44.86 
 
 		 596 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  43.52 
 
 		 592 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  43.78 
 
 		 586 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  42.44 
 
 		 595 aa  465  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  38.44 
 
 		 579 aa  402  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  38.16 
 
 		 619 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  37.26 
 
 		 580 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  34.22 
 
 		 611 aa  302  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06130  conserved hypothetical protein  39.54 
 
 		 522 aa  300  5e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 555 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  30.07 
 
 		 590 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32 
 
 		 543 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.22 
 
 		 545 aa  233  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.98 
 
 		 539 aa  226  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  30.74 
 
 		 524 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.31 
 
 		 539 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.47 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.31 
 
 		 544 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.49 
 
 		 539 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  31.48 
 
 		 540 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  27.97 
 
 		 544 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.82 
 
 		 539 aa  219  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.15 
 
 		 539 aa  218  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.07 
 
 		 541 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  28.6 
 
 		 539 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  31.15 
 
 		 523 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  31.1 
 
 		 504 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  30.58 
 
 		 511 aa  206  8e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  30.77 
 
 		 556 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  30.92 
 
 		 543 aa  193  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  32.26 
 
 		 520 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  32.24 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.99 
 
 		 531 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  28.62 
 
 		 564 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  29.12 
 
 		 559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07415  conserved hypothetical protein  32.62 
 
 		 524 aa  170  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.300913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  28.57 
 
 		 557 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  27.2 
 
 		 624 aa  158  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  28.1 
 
 		 519 aa  157  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  27.79 
 
 		 578 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  27.4 
 
 		 562 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  27.79 
 
 		 536 aa  148  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  32.7 
 
 		 481 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.74 
 
 		 546 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  27.15 
 
 		 606 aa  143  7e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  27.73 
 
 		 564 aa  143  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  31.11 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  31.11 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  31.11 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  27.71 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  31.69 
 
 		 968 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  27.37 
 
 		 617 aa  133  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.38 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  28.5 
 
 		 511 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  32.25 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  32 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  27.84 
 
 		 518 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  29.5 
 
 		 479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  29.49 
 
 		 544 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  29.65 
 
 		 535 aa  127  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  29.82 
 
 		 552 aa  127  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  29.67 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 		 565 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  30.34 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  30.34 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  30.98 
 
 		 477 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  31.43 
 
 		 508 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  30.93 
 
 		 475 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  29.33 
 
 		 478 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  29.33 
 
 		 478 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07251  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 		 581 aa  123  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.261689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  29.52 
 
 		 553 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  26.81 
 
 		 485 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  28.01 
 
 		 503 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  29.23 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.27 
 
 		 529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  29.66 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  30.79 
 
 		 505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  29.33 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  27.99 
 
 		 506 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  29.67 
 
 		 506 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  29.43 
 
 		 511 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  27.67 
 
 		 537 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  29.92 
 
 		 486 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  29.83 
 
 		 493 aa  117  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  29.08 
 
 		 388 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  31.55 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  28.88 
 
 		 576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  28.09 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>