215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2007 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2007  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
417 aa  842    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1720  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.25 
 
 
419 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.52 
 
 
457 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.97 
 
 
420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0050  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.11 
 
 
420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0773  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.39 
 
 
435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 
437 aa  106  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.3 
 
 
450 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0838  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.14 
 
 
420 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1493  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.73 
 
 
420 aa  103  7e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.68 
 
 
447 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.15 
 
 
445 aa  96.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.09 
 
 
450 aa  96.3  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.83 
 
 
462 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.53 
 
 
441 aa  86.7  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.24 
 
 
433 aa  86.3  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.6 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.26 
 
 
443 aa  84  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0719088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  25.31 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.77 
 
 
442 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  23.84 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.43 
 
 
436 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.5 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.34 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.25 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.19 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.45 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.06 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  22.8 
 
 
449 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.89 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.24 
 
 
445 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.73 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  29.3 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.43 
 
 
427 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.86 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.77 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.3 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  22.09 
 
 
449 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.06 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.76 
 
 
438 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.38 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0779  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase  21.74 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0996671  unclonable  0.000000000000263997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.07 
 
 
465 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.52 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  28.4 
 
 
473 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3957  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.62 
 
 
440 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.259063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4727  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.31 
 
 
431 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.3 
 
 
450 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.31 
 
 
465 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2764  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.64 
 
 
446 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1937  DNA gyrase modulator peptidase U62  20.84 
 
 
437 aa  63.2  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.227653  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.77 
 
 
465 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0403  microcin-processing peptidase 1  26.74 
 
 
449 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0481166  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0473  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.69 
 
 
445 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0351286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.75 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  27.8 
 
 
460 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.23 
 
 
479 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.17 
 
 
463 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.49 
 
 
448 aa  60.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  24.77 
 
 
446 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0352  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.76 
 
 
452 aa  60.1  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.678191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  23.2 
 
 
490 aa  60.1  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.89 
 
 
465 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.01 
 
 
469 aa  59.7  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.66 
 
 
448 aa  59.7  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.87 
 
 
427 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.6 
 
 
446 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.21 
 
 
448 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.34 
 
 
460 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  25.82 
 
 
448 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  25.59 
 
 
448 aa  57  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.55 
 
 
446 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.19 
 
 
448 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  22.44 
 
 
452 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.94 
 
 
447 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.26 
 
 
468 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 
470 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2178  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.14 
 
 
446 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  24.61 
 
 
464 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3908  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.75 
 
 
440 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.13 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1289  putative modulator of DNA gyrase  23.67 
 
 
446 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.387477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.11 
 
 
460 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.08 
 
 
440 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2130  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.14 
 
 
446 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1475  DNA gyrase modulator peptidase U62  25.68 
 
 
453 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  21.8 
 
 
452 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  23.72 
 
 
444 aa  53.9  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.43 
 
 
473 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  20.92 
 
 
434 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000861  predicted Zn-dependent protease  23.67 
 
 
447 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.33 
 
 
460 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.36 
 
 
448 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 
448 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3845  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.42 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.55 
 
 
463 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  21.78 
 
 
461 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  21.78 
 
 
461 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  26.42 
 
 
446 aa  53.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0355671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>