More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1898 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1898  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 
352 aa  690    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180885  normal  0.286914 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1301  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  66.19 
 
 
352 aa  490  1e-137  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1082  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.06 
 
 
337 aa  231  1e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.524281  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0658  NADH dehydrogenase subunit H  39.08 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0328  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.91 
 
 
320 aa  200  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2048  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.17 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110372 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2275  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  36.45 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0754968  normal  0.291328 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0303  NADH dehydrogenase subunit H  35.26 
 
 
361 aa  196  7e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.594505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1633  NADH dehydrogenase subunit H  36.23 
 
 
350 aa  194  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0515  NADH dehydrogenase subunit H  36.36 
 
 
341 aa  188  9e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0646  NADH dehydrogenase subunit H  39.16 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.411826  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1793  NADH dehydrogenase (quinone)  35.99 
 
 
320 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.096157  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  31.14 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  33.14 
 
 
372 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  31.7 
 
 
372 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  30.09 
 
 
372 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  31.07 
 
 
372 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  30.75 
 
 
384 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  36.25 
 
 
333 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  36.25 
 
 
333 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  36.25 
 
 
333 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  31.07 
 
 
372 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  36.25 
 
 
333 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  36.25 
 
 
333 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  36.25 
 
 
333 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  31.07 
 
 
372 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  35.6 
 
 
333 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  36.25 
 
 
333 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  36.25 
 
 
333 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  36.25 
 
 
333 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  36.25 
 
 
333 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  30.55 
 
 
384 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  30.09 
 
 
372 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  32.28 
 
 
372 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.23 
 
 
329 aa  156  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  33.65 
 
 
348 aa  155  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  31.12 
 
 
372 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  34.19 
 
 
333 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  31.18 
 
 
432 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.44 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  33.52 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  33.52 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  30.45 
 
 
372 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  34.3 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.93 
 
 
349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  34.3 
 
 
333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0318  NADH dehydrogenase  34.84 
 
 
317 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  31.27 
 
 
349 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  30.42 
 
 
349 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1998  NADH dehydrogenase subunit H  34.78 
 
 
345 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222188  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.81 
 
 
366 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  32.85 
 
 
341 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  33.03 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.82 
 
 
349 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.36 
 
 
344 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1941  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.12 
 
 
331 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.552333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.09 
 
 
343 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  30.57 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  30.57 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  32.08 
 
 
352 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  32.48 
 
 
341 aa  138  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  30.21 
 
 
330 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0666  NADH dehydrogenase (quinone)  32.27 
 
 
317 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3131  NADH dehydrogenase (quinone)  29.39 
 
 
364 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0280  NADH dehydrogenase subunit H  30.56 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  30.12 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  30.14 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  32.48 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  30.56 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  30.84 
 
 
347 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.31 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0785  NADH dehydrogenase subunit H  31.99 
 
 
348 aa  133  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.181346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2412  NADH dehydrogenase subunit H  31.48 
 
 
373 aa  133  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  31.33 
 
 
367 aa  133  6e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1308  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.52 
 
 
354 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.69 
 
 
339 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  33.93 
 
 
451 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1597  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  30.28 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  29.86 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  32.17 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  29.73 
 
 
351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  29.97 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.86 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2522  NADH dehydrogenase subunit H  32.3 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  30.94 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1184  NADH dehydrogenase subunit H  32.3 
 
 
341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503975  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.23 
 
 
347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656687  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  30.43 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
353 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0809  NADH dehydrogenase subunit H  30.94 
 
 
347 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519776  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  30.56 
 
 
357 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  29.2 
 
 
354 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0804  NADH dehydrogenase subunit H  30.94 
 
 
347 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  30.21 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  32.14 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.56 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2416  NADH dehydrogenase subunit H  30.63 
 
 
347 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792289  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  30.22 
 
 
440 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>