49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1728 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1728  transcription factor  100 
 
 		 176 aa  356  9e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.419666  normal  0.701049 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1927  TATA-box binding family protein  88.1 
 
 		 181 aa  313  9e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.688895  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1206  transcription factor  56.73 
 
 		 194 aa  211  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.693601  hitchhiker  0.00093313 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1078  transcription factor  55.28 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0807  transcription factor  53.42 
 
 		 199 aa  189  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.364807  hitchhiker  0.00198948 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0806  transcription factor  53.42 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1352  transcription factor  52.8 
 
 		 197 aa  184  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.496063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0598  2-alkenal reductase  53.99 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0293  TATA-box binding  62.5 
 
 		 142 aa  177  9e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000761553  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1519  TATA-box binding family protein  50.31 
 
 		 187 aa  174  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00147991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1250  transcription factor  48.77 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0721  TATA-box binding family protein  47.53 
 
 		 186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0447  transcription factor  44.64 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0133  TATA-box binding family protein  46.39 
 
 		 186 aa  160  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1863  TATA-box binding family protein  46.91 
 
 		 186 aa  160  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0971  TATA-box binding family protein  47.9 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3413  transcription factor  45.12 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1260  transcription factor  48.43 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0729165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0186  transcription factor  46.54 
 
 		 181 aa  154  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1523  transcription factor  48.15 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.302764  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0696  transcription factor  47.17 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1320  transcription factor  45.4 
 
 		 186 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1416  transcription factor  45.91 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.223382  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1270  transcription factor  48.43 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0568  transcription factor  44.31 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.279117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1388  transcription factor  43.29 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0152  transcription factor  44.72 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.939058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0595  transcription factor  42.07 
 
 		 183 aa  144  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0916  transcription factor  45 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000134892  hitchhiker  0.00000000296214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2629  transcription factor  45.68 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0323  transcription factor  40.24 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.940017  normal  0.981502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1062  transcription factor  45.45 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1496  transcription factor  41.46 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000221739  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1680  transcription factor  40.24 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2099  transcription factor  38.41 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2006  transcription factor  36.59 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.720701  normal  0.180889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1252  transcription factor  38.51 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0593  transcription factor  38.41 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.516283  normal  0.112679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0864  transcription factor  38.41 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0440  transcription factor  38.65 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38880  TATA-binding protein  42.33 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.130977  normal  0.751023 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26716  predicted protein  41.1 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258569  normal  0.155129 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01090  general RNA polymerase II transcription factor, putative  40.49 
 
 		 232 aa  121  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04976  TATA-box-binding protein (TATA-box factor)(TATA-binding factor)(TATA sequence-binding protein)(TBP)(Transcription initiation factor TFIID TBP subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12731]  42.24 
 
 		 284 aa  121  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.419076  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10199  predicted protein  42.14 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478324  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3287  transcription factor  38.04 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0612  transcription factor  37.84 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.298266  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1917  TATA-box binding family protein  36.88 
 
 		 291 aa  97.4  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2818  TATA-box binding family protein  24.73 
 
 		 123 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>