More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1604 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1604  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 352 aa  701    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0798438  normal  0.128956 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1356  Nucleotidyl transferase  58.76 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0086  sugar-phosphate nucleotidyl transferase  31.25 
 
 		 377 aa  156  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.387197  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0427  nucleotidyl transferase  28.14 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1694  nucleotidyl transferase  29.23 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00229332  normal  0.012326 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1001  nucleotidyl transferase  29.08 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1777  nucleotidyl transferase  26.03 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13003  normal  0.0200486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.16 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.77 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0529  hexapaptide repeat-containing transferase  27.86 
 
 		 350 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.99 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  26.36 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  25.66 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  28.91 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  26.84 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  28.32 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  26.54 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  27.72 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  27.41 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  29.3 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.3 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  25.56 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  29.71 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  26.74 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  27.22 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.74 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.78 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  23.3 
 
 		 405 aa  99.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.88 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  27.1 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.88 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  26.25 
 
 		 393 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.69 
 
 		 357 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.82 
 
 		 355 aa  95.9  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  26.14 
 
 		 366 aa  95.9  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.59 
 
 		 355 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  25.43 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  25.51 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  24.73 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.4 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  25.54 
 
 		 393 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  23.88 
 
 		 785 aa  93.2  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.26 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.84 
 
 		 358 aa  92.8  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  25.65 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  26.24 
 
 		 393 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  24.94 
 
 		 712 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  25.69 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.79 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  26.95 
 
 		 784 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.08 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  27.25 
 
 		 784 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  26.87 
 
 		 784 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.87 
 
 		 784 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  26.87 
 
 		 784 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  27.25 
 
 		 784 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  24.73 
 
 		 384 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  24.32 
 
 		 401 aa  89.4  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  26.14 
 
 		 385 aa  89.4  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.87 
 
 		 784 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  23.6 
 
 		 828 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  26.56 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  26.57 
 
 		 784 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.87 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  24.41 
 
 		 818 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  25.97 
 
 		 784 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.63 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  26.35 
 
 		 784 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.18 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  23.39 
 
 		 361 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.88 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.91 
 
 		 364 aa  85.9  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.22 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  26.11 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.33 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  26.57 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  28.96 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  23.44 
 
 		 820 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.19 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  25.53 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  23.12 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  27.43 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  26.33 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.71 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  24.25 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2516  Nucleotidyl transferase  26.98 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  26.63 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  24.92 
 
 		 828 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.85 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  24.3 
 
 		 820 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  25.73 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.21 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.3 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  25.28 
 
 		 818 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  25.29 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  27.01 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.3 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  25.87 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  24.05 
 
 		 835 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  30.57 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>