122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0544 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0544  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 610 aa  1231    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.854684  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1003  conserved hypothetical protein  32.91 
 
 		 619 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1453  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.66 
 
 		 471 aa  53.5  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00604252  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3046  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  28.23 
 
 		 1190 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  32.67 
 
 		 477 aa  51.6  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0612  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.38 
 
 		 752 aa  50.8  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  36.78 
 
 		 456 aa  50.4  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0885  iron-sulfur cluster binding protein  38.16 
 
 		 474 aa  49.3  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19830  (4Fe-4S) cluster-containing protein  26.57 
 
 		 528 aa  49.7  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0070  iron-sulfur cluster binding protein  37.33 
 
 		 479 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0111  iron-sulfur cluster binding protein  37.33 
 
 		 479 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0085  iron-sulfur cluster binding protein  37.33 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4369  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  25.14 
 
 		 1193 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.278517 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  23.75 
 
 		 482 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  23.75 
 
 		 482 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3623  protein of unknown function DUF162  26.15 
 
 		 465 aa  48.5  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  23.75 
 
 		 477 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  23.75 
 
 		 477 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3504  ferredoxin  39.76 
 
 		 312 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1261  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 1222 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  36.76 
 
 		 463 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  23.75 
 
 		 477 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  23.75 
 
 		 477 aa  48.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 392 aa  48.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.683323  normal  0.0188161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  24.67 
 
 		 473 aa  47.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 411 aa  47.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0142218  hitchhiker  0.00000000000291974 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  27.98 
 
 		 494 aa  47.8  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  35.38 
 
 		 475 aa  47.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  24.83 
 
 		 1000 aa  47.8  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  25 
 
 		 470 aa  47.4  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  28.48 
 
 		 494 aa  47.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4211  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 467 aa  47.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  25.79 
 
 		 470 aa  47.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3918  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 1212 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2156  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.01 
 
 		 673 aa  47.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261031  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2721  Iron-sulfur cluster binding protein  33.72 
 
 		 471 aa  47.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  34.94 
 
 		 483 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  34.94 
 
 		 483 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  33.73 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  33.73 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.94 
 
 		 483 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.94 
 
 		 536 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  34.94 
 
 		 483 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  34.94 
 
 		 483 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  34.94 
 
 		 483 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  27.85 
 
 		 494 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3966  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  26.98 
 
 		 1212 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  33.73 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.98 
 
 		 900 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  33.8 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5745  protein of unknown function DUF162  26.99 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00670612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4921  protein of unknown function DUF162  35.71 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236618  normal  0.296913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  27.94 
 
 		 463 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.53 
 
 		 470 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2323  electron transport complex protein RnfC  33.64 
 
 		 737 aa  46.6  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 314 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  32.84 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  25.34 
 
 		 501 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2145  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.82 
 
 		 989 aa  46.2  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  39.19 
 
 		 653 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0775  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 158 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.626563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  28.99 
 
 		 494 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  24.31 
 
 		 738 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2000  iron-sulfur cluster binding protein  37.04 
 
 		 481 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  32.73 
 
 		 747 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  33.85 
 
 		 475 aa  45.8  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 		 475 aa  45.8  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.18 
 
 		 900 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0064  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  31.68 
 
 		 1171 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.789886  normal  0.0727512 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  23.12 
 
 		 482 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  33.73 
 
 		 522 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1409  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.09 
 
 		 257 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  33.75 
 
 		 512 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3703  iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 		 496 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0892333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0374  iron-sulfur cluster binding protein  33.73 
 
 		 495 aa  45.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 		 473 aa  45.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2883  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.41 
 
 		 453 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 		 475 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3285  iron-sulfur cluster-binding protein  28.41 
 
 		 453 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3731  iron-sulfur cluster binding protein  34.04 
 
 		 494 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.210686  normal  0.445104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3931  protein of unknown function DUF162  22.69 
 
 		 459 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.463483 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  33.85 
 
 		 475 aa  45.8  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 		 479 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12940  (4Fe-4S) cluster-containing protein  37.5 
 
 		 509 aa  45.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 		 475 aa  45.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 		 475 aa  45.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 		 475 aa  45.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 		 475 aa  45.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3132  molybdopterin oxidoreductase  31.94 
 
 		 815 aa  45.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  34.12 
 
 		 475 aa  44.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1080  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  28.57 
 
 		 1190 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  32.94 
 
 		 458 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  30.43 
 
 		 469 aa  44.3  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  35.38 
 
 		 470 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  35.38 
 
 		 470 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2899  iron-sulfur cluster binding protein  32.22 
 
 		 478 aa  44.3  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3066  protein of unknown function DUF162  26.45 
 
 		 458 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>