154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0612 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0203  FAD linked oxidase domain protein  43.36 
 
 		 740 aa  647    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0612  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 752 aa  1542    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0554  hypothetical protein  27.75 
 
 		 339 aa  66.6  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0901  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.17 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0189  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  32.2 
 
 		 453 aa  56.2  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.103269  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0481  hypothetical protein  28.24 
 
 		 421 aa  55.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0193589  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33 
 
 		 438 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33 
 
 		 438 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  33.33 
 
 		 458 aa  54.3  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  22.52 
 
 		 410 aa  53.5  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0818138  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3258  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  27.83 
 
 		 424 aa  52.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  32.17 
 
 		 483 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  32.17 
 
 		 483 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  32.17 
 
 		 483 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  32.29 
 
 		 507 aa  52  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  32.17 
 
 		 536 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  32.17 
 
 		 483 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  32.17 
 
 		 483 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  32.17 
 
 		 483 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30 
 
 		 453 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  26.92 
 
 		 1015 aa  51.6  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0125  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  26.96 
 
 		 415 aa  51.6  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0581331  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.18 
 
 		 447 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.18 
 
 		 447 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1172  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  21.59 
 
 		 418 aa  50.8  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.416394 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 392 aa  50.8  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.683323  normal  0.0188161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0175  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  33.33 
 
 		 449 aa  50.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.62 
 
 		 471 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3498  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.67 
 
 		 463 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1453  putative iron-sulfur cluster binding protein  30.63 
 
 		 471 aa  50.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00604252  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0544  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.4 
 
 		 610 aa  49.7  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.854684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.64 
 
 		 989 aa  49.7  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2919  hypothetical protein  35.14 
 
 		 472 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0224  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  21.36 
 
 		 410 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  32.53 
 
 		 416 aa  49.3  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  21.54 
 
 		 408 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  31.31 
 
 		 470 aa  49.3  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  21.53 
 
 		 408 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  21.54 
 
 		 408 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  21.53 
 
 		 408 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2145  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30 
 
 		 419 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1024 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  21.54 
 
 		 408 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0306  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  22.33 
 
 		 416 aa  49.3  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1221  hypothetical protein  33.73 
 
 		 385 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.339295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.78 
 
 		 445 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1015 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  34.33 
 
 		 450 aa  48.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  36.11 
 
 		 412 aa  48.5  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  34.25 
 
 		 433 aa  48.1  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.56 
 
 		 453 aa  48.5  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  32.94 
 
 		 428 aa  48.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1962  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 411 aa  48.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0142218  hitchhiker  0.00000000000291974 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2012  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.9 
 
 		 384 aa  48.1  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0718  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.07 
 
 		 408 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  28.72 
 
 		 475 aa  48.1  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1219  hypothetical protein  29.35 
 
 		 490 aa  48.1  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.158423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  28.72 
 
 		 475 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  28.72 
 
 		 475 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  28.72 
 
 		 475 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  28.72 
 
 		 475 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  28.72 
 
 		 475 aa  48.1  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  28.72 
 
 		 475 aa  48.1  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  32.97 
 
 		 522 aa  47.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3980  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  23.62 
 
 		 408 aa  47.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  28.72 
 
 		 475 aa  48.1  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  28.72 
 
 		 475 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1003  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 		 619 aa  47.8  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1499  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  26.32 
 
 		 402 aa  47.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0363291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3313  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.53 
 
 		 411 aa  47.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1188  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  23.84 
 
 		 457 aa  47.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2516  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.13 
 
 		 408 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0531711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.25 
 
 		 543 aa  47.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0174  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.67 
 
 		 471 aa  47.4  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  27.37 
 
 		 473 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.87 
 
 		 470 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  30.77 
 
 		 471 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  22.37 
 
 		 375 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  30.77 
 
 		 471 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0244  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.74 
 
 		 419 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3311  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  25.45 
 
 		 412 aa  47  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.530471  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  30.77 
 
 		 470 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.85 
 
 		 445 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  28.42 
 
 		 475 aa  47  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.06 
 
 		 722 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  28.42 
 
 		 473 aa  47.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.76 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1024 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  21.54 
 
 		 408 aa  47.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  32 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  27.01 
 
 		 710 aa  46.6  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  31.87 
 
 		 470 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.88 
 
 		 474 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0341  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.67 
 
 		 471 aa  46.6  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00798095 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1568  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  23.95 
 
 		 420 aa  46.6  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000718376  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0353  hypothetical protein  32.84 
 
 		 449 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0961  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  20.54 
 
 		 411 aa  46.6  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 472 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  30.77 
 
 		 470 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>