More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2906 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2906  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2228  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 227 aa  131  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  35.57 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  35.57 
 
 		 196 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  35.57 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  35.57 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  35.57 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  35.57 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  35.05 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  33.51 
 
 		 196 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 237 aa  72  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 232 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  32.73 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  27.61 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  35.81 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.16 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.25 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.25 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.25 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  33.33 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  25.87 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  34.09 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1516  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.481804 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.46 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 411 aa  65.9  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.34 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  31.64 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  34.09 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  31.52 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  31.52 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  31.64 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  31.52 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.05 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.05 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.18 
 
 		 442 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  30.91 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.54 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.05 
 
 		 200 aa  62  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 220 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 220 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 220 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.63 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.72 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.09 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  31.13 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  29.84 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  34.76 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>