110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2635 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2635  putative 2-nitropropane dioxygenase  100 
 
 
491 aa  986    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1713  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.51 
 
 
475 aa  545  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000796531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0981  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.32 
 
 
472 aa  498  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4298  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.03 
 
 
481 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15389  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3653  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.2 
 
 
472 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.042009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1446  putative 2-nitropropane dioxygenase  57.14 
 
 
486 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00192568  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1622  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.26 
 
 
487 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0849  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.64 
 
 
505 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.183629  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1611  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.59 
 
 
485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0274193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5685  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.28 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50353  predicted protein  48.03 
 
 
553 aa  425  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0610  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.88 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.47 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2272  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  24.44 
 
 
424 aa  67  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0779  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.65 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1025  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.23 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0766  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.29 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0843777 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0188  hypothetical protein  24.64 
 
 
417 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0706904  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0500  hypothetical protein  24.18 
 
 
419 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.546917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1164  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.12 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121776  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.48 
 
 
361 aa  63.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0405  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.73 
 
 
376 aa  63.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1586  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.6 
 
 
373 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.385159  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3641  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.76 
 
 
386 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1939  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.64 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2314  2-nitropropane dioxygenase  23.72 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3317  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.51 
 
 
382 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2873  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.83 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1305  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.93 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.302592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1792  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.93 
 
 
396 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.34549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0103  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.93 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2128  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.93 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2183  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.93 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1062  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.93 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0406  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.76 
 
 
357 aa  57.4  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.25833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0114  hypothetical protein  23.61 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1055  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24 
 
 
361 aa  56.6  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.455716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1249  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  23.73 
 
 
355 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1283  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.64 
 
 
396 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.756319 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2347  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.16 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6039  hitchhiker  0.000000126588 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1334  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.58 
 
 
414 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0670  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.95 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0977  2-nitropropane dioxygenase NPD  20.51 
 
 
380 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652012  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4504  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.29 
 
 
338 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372283  normal  0.089603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2248  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.08 
 
 
360 aa  54.3  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.69113  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5565  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.12 
 
 
405 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286036  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0006  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.3 
 
 
332 aa  54.3  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1061  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  22.13 
 
 
355 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.992497  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1538  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.27 
 
 
414 aa  53.9  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1184  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.78 
 
 
414 aa  53.9  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2182  putative dioxygenase related to 2-nitropropane dioxygenase  25.14 
 
 
414 aa  53.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000148707  unclonable  0.000000279866 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1851  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.27 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000135103  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3113  2-nitropropane dioxygenase NPD  21.49 
 
 
352 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1506  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.18 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.186362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4381  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.79 
 
 
417 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.7 
 
 
342 aa  52.4  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2083  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.35 
 
 
393 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1757  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.31 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1705  2-nitropropane dioxygenase  24.63 
 
 
438 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1676  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.38 
 
 
396 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0582286  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3148  2-nitropropane dioxygenase-like dioxygenase  24.55 
 
 
369 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0185089  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.52 
 
 
396 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0721  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.01 
 
 
363 aa  51.6  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.214896  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.82 
 
 
334 aa  51.6  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0649  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.54 
 
 
365 aa  51.6  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0498  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  21.2 
 
 
363 aa  52  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.142021  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6322  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.1 
 
 
396 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1681  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.38 
 
 
396 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2391  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.42 
 
 
414 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2896  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.42 
 
 
414 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2314  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.46 
 
 
396 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1803  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  24 
 
 
392 aa  50.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0152  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.38 
 
 
345 aa  50.1  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.174988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2188  putative 2-nitropropane dioxygenase  25.77 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000766761 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2694  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  24.42 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1770  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.11 
 
 
396 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.763797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1158  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.29 
 
 
357 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0552766 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0091  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.22 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0622  hypothetical protein  25.21 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2815  2-nitropropane dioxygenase  24.42 
 
 
392 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3306  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.11 
 
 
342 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.152065  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1945  putative 2-nitropropane dioxygenase  24.02 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00553543  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0038  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.49 
 
 
352 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2751  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.21 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76383  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1009  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.21 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.65 
 
 
325 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2913  2-nitropropane dioxygenase, NPD  23.91 
 
 
315 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000125004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.88 
 
 
314 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0744  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.26 
 
 
354 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0974  trans-2-enoyl-ACP reductase II  28.32 
 
 
348 aa  48.1  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1279  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  21.2 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5061  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.74 
 
 
415 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0485  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  20.63 
 
 
365 aa  47.8  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.5 
 
 
326 aa  47  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  34.65 
 
 
311 aa  47  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0133  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.09 
 
 
352 aa  46.6  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.899957  normal  0.134277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2985  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.57 
 
 
364 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1210  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  21.63 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0098  hypothetical protein  31.43 
 
 
343 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0084  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.43 
 
 
343 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00133989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>