41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6395 on replicon NC_010514
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  278  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  50.41 
 
 
128 aa  114  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  46.03 
 
 
134 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  52.29 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  47.37 
 
 
127 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  47.79 
 
 
128 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  44.92 
 
 
127 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  44.72 
 
 
125 aa  104  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  45.79 
 
 
113 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  46.09 
 
 
121 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  48.57 
 
 
123 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  45.54 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  43.86 
 
 
123 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  44.74 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  45.45 
 
 
82 aa  67  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  35.59 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  37.86 
 
 
120 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  34.91 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  35.92 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  35.23 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  35.23 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  36.73 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  35.23 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  35.23 
 
 
112 aa  53.9  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  31.58 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  35.71 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  32 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  33.04 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  34.43 
 
 
112 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  29.46 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  25.23 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  31.48 
 
 
117 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  31.87 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  30.95 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  31.68 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  30.1 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  28.89 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>