32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5002 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  100 
 
 		 610 aa  1150    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  42.77 
 
 		 632 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  42.46 
 
 		 632 aa  363  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  41.87 
 
 		 634 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  40.87 
 
 		 611 aa  301  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  40.29 
 
 		 580 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  29.91 
 
 		 656 aa  159  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  29.23 
 
 		 643 aa  156  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  27.92 
 
 		 654 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  27.26 
 
 		 655 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  27.64 
 
 		 645 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  26.45 
 
 		 648 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  28.42 
 
 		 649 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  27.72 
 
 		 655 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  26.27 
 
 		 642 aa  96.3  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  29.41 
 
 		 654 aa  95.1  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  26.98 
 
 		 608 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  23.93 
 
 		 645 aa  81.3  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  23.49 
 
 		 649 aa  76.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  23.75 
 
 		 645 aa  73.9  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  22.51 
 
 		 603 aa  67  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  21.31 
 
 		 626 aa  61.2  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  22.25 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  26.53 
 
 		 602 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  23.13 
 
 		 630 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  22.14 
 
 		 630 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  26.47 
 
 		 660 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  25.79 
 
 		 660 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  23.02 
 
 		 1013 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  22.73 
 
 		 651 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  23.65 
 
 		 700 aa  45.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  20.41 
 
 		 712 aa  45.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>