46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3178 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  76.72 
 
 		 235 aa  327  7e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  76.29 
 
 		 235 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  79.19 
 
 		 259 aa  307  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  48.56 
 
 		 236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  47.27 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  47.73 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  45.85 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  45.85 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  42.93 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  50.33 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  47.16 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  41.71 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  44.33 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  41.24 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  43.38 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  41.5 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  44.51 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  37.95 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  45 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  41.63 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  42.31 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  42.31 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  42.31 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  44.87 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  44.87 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  41.46 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  34.29 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  36.74 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  31.76 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  31.2 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  34.6 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  34.21 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  29.8 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  34.68 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  34.68 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  30.28 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  32.4 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  36.15 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  33.91 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  26.97 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  30.87 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  41.43 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  28.87 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  28.7 
 
 		 259 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2058  protein of unknown function DUF1275  32.63 
 
 		 230 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0018845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>