174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2175 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 152 aa  315  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  79.61 
 
 		 152 aa  253  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  78.95 
 
 		 152 aa  251  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  78.95 
 
 		 152 aa  251  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5925  cyclase/dehydrase  75 
 
 		 151 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6534  cyclase/dehydrase  73.03 
 
 		 151 aa  229  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00656463  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  65.77 
 
 		 150 aa  200  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  65.54 
 
 		 150 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  58.39 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2573  cyclase/dehydrase  56.38 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.720561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  57.05 
 
 		 155 aa  188  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2585  cyclase/dehydrase  57.72 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  hitchhiker  0.00428625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3898  cyclase/dehydrase  59.73 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.514225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2887  cyclase/dehydrase  56.38 
 
 		 157 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  60 
 
 		 151 aa  182  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  57.05 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  58.67 
 
 		 152 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1440  cyclase/dehydrase  57.72 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0524  cyclase/dehydrase  56.95 
 
 		 152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  56 
 
 		 150 aa  177  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  57.89 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1512  cyclase/dehydrase  57.33 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.530425 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  55.33 
 
 		 153 aa  174  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  57.33 
 
 		 149 aa  173  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  61.19 
 
 		 136 aa  166  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  43.05 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  43.05 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  44.37 
 
 		 147 aa  143  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  45.33 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3135  cyclase/dehydrase  45.03 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  44.67 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  43.05 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1580  putative polyketide cyclase / dehydrase  42.76 
 
 		 171 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  44.44 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  42.67 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  42.95 
 
 		 153 aa  126  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  43.33 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  40.67 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  39.6 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  34.9 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  35.76 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  37.75 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2750  cyclase/dehydrase  38.67 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0445  cyclase/dehydrase  32.67 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  36.91 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1529  cyclase/dehydrase  37.86 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  36.91 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  33.55 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2058  cyclase/dehydrase  35.33 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00806179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  33.55 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1437  cyclase/dehydrase  39.86 
 
 		 166 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00296077  hitchhiker  0.00000517245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  36.24 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3005  cyclase/dehydrase  34.25 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  36.24 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  35.57 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  36.24 
 
 		 145 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  36.91 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  36.24 
 
 		 145 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2004  cyclase/dehydrase  32.24 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0398865  normal  0.691542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  34.9 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1755  hypothetical protein  37.32 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  36.91 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  33.56 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  32.21 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  33.09 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  33.56 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  30.41 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0527  cyclase/dehydrase  34.03 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  32.24 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  32.17 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  33.11 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  34.44 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  34.44 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  34.44 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  34.44 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  34.44 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1425  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  30.87 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  32.19 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  34.44 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  34.44 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  34.44 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  34.44 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1408  cyclase/dehydrase  32.89 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1454  polyketide cyclase/dehydrase family protein  34.87 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000012561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  33.78 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1392  oligoketide cyclase/lipid transport protein  34.87 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000575207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3828  aromatic rich family protein  30.92 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1521  cyclase/dehydrase  31.58 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351498  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  33.11 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  33.11 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  33.11 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  32.65 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  33.11 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  31.58 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>