167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2581 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2581  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.405095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1033  protein of unknown function DUF305  86.44 
 
 		 234 aa  390  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2580  hypothetical protein  63.64 
 
 		 94 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1032  hypothetical protein  59.74 
 
 		 94 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4604  hypothetical protein  51.14 
 
 		 94 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.647307  normal  0.246426 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4901  hypothetical protein  57.33 
 
 		 104 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4823  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  92  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1093  hypothetical protein  54.12 
 
 		 101 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  55.71 
 
 		 94 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4270  hypothetical protein  53.25 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  49.33 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  45.35 
 
 		 121 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  45.33 
 
 		 115 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  50.68 
 
 		 94 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  37.38 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  48.65 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  48.65 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  48.65 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5864  hypothetical protein  49.28 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  44.71 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  52.24 
 
 		 115 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0316  hypothetical protein  41.41 
 
 		 100 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0877405  normal  0.0871096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  44.16 
 
 		 115 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6069  hypothetical protein  42.55 
 
 		 111 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387914  normal  0.0699917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  42.68 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  43.24 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  44.3 
 
 		 114 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  50.75 
 
 		 120 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  44.59 
 
 		 116 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1203  hypothetical protein  44.19 
 
 		 120 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  44.3 
 
 		 114 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  45.95 
 
 		 116 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  44.3 
 
 		 114 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  45.83 
 
 		 97 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  45.83 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  49.25 
 
 		 95 aa  72  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  50.72 
 
 		 123 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6521  putative periplasmic copper binding protein  50 
 
 		 98 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  40.24 
 
 		 116 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  46.03 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  38.89 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  46.03 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  49.28 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  38.1 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4171  RND family efflux transporter MFP subunit  41.67 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.339982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  43.06 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_003296  RS05404  putative signal peptide protein  45.78 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1880  hypothetical protein  39.02 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0613491  normal  0.740348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  40.54 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  40.54 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  38.16 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  37.33 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  40.22 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  40.28 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  45.71 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1810  conserved hypothetical periplasmic protein  45.12 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.128399  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  41.54 
 
 		 115 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1205  hypothetical protein  36.54 
 
 		 135 aa  62  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  41.54 
 
 		 115 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2603  hypothetical protein  36.54 
 
 		 136 aa  62  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.516618  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  40.26 
 
 		 113 aa  62  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4635  hypothetical protein  40.54 
 
 		 99 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.438517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  37.25 
 
 		 114 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1857  hypothetical protein  39.19 
 
 		 105 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  36.26 
 
 		 112 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  48.53 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  37.1 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1674  hypothetical protein  45.45 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  37.5 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5031  hypothetical protein  45.28 
 
 		 94 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9842  hypothetical protein  45.28 
 
 		 94 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  43.86 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  43.1 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  48.15 
 
 		 150 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2262  hypothetical protein  40 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9848  hypothetical protein  45.28 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0515  hypothetical protein  37.14 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3912  hypothetical protein  38.36 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438117  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4456  hypothetical protein  38.36 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5848  RND family efflux transporter MFP subunit  38.36 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3377  hypothetical protein  37.14 
 
 		 105 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0416  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  45.45 
 
 		 490 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3047  hypothetical protein  37.14 
 
 		 113 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2045  hypothetical protein  37.14 
 
 		 113 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0320  hypothetical protein  37.14 
 
 		 113 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0333  hypothetical protein  37.14 
 
 		 113 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2239  hypothetical protein  37.14 
 
 		 113 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  45.45 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  42.19 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 523 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  28 
 
 		 134 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.69 
 
 		 537 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  38.46 
 
 		 127 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  39.73 
 
 		 151 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2442  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  40.58 
 
 		 122 aa  52.4  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>