207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3339 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  418  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  64.97 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  59.59 
 
 		 212 aa  234  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  62.18 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  62.18 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  57.73 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  56.7 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  56.7 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  56.19 
 
 		 210 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  52.76 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  53.81 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  52.71 
 
 		 204 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  50.5 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  50.47 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  50.5 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  52 
 
 		 204 aa  207  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  53.77 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  52.76 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  47.78 
 
 		 204 aa  198  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  52.26 
 
 		 228 aa  197  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  49.22 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  48.22 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  49.49 
 
 		 238 aa  194  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  51.81 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  48.19 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  53.89 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  50.26 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  50.77 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  49.75 
 
 		 202 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  52.6 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  48.51 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  49.52 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  50.77 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  50.51 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  46.8 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  46.63 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  50.26 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  48.74 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  51.28 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  46.39 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  43.08 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  43.3 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  45.31 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  42.49 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  42.71 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  43.3 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  45.92 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  42.13 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  41.15 
 
 		 198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  47.64 
 
 		 233 aa  128  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  37.7 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  39.27 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  37.5 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  37.5 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  38.02 
 
 		 204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  53.85 
 
 		 109 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  41.67 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  36.96 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  36.91 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  33.76 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  30 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  29.7 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  28.85 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  32.9 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  28 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  26.32 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  32.85 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  28.65 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  35.26 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  23.31 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  29.26 
 
 		 306 aa  68.2  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  31.29 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  27.65 
 
 		 313 aa  65.1  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  26.81 
 
 		 295 aa  64.7  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  26.9 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  31.41 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  26.19 
 
 		 285 aa  61.6  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  26.8 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1826  hypothetical protein  28.27 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  26.19 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  28.02 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  26.16 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  30.49 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  29.65 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0494  hypothetical protein  27.85 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2046  protein of unknown function DUF161  26.47 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.302347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2836  protein of unknown function DUF161  29.41 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  25.26 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  26.88 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16380  hypothetical protein  28.99 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000759545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0536  hypothetical protein  25.79 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  25.61 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  23.67 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  25.61 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2920  protein of unknown function DUF161  25.49 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000232125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0967  hypothetical protein  30.05 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.69732  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  30.19 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  25 
 
 		 299 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  24.84 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>