108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2795 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2795  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  661    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1003  putative metal dependent phosphohydrolase  44.23 
 
 
423 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1852  putative metal dependent phosphohydrolase  39.3 
 
 
349 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4666  putative metal dependent phosphohydrolase  36.58 
 
 
403 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3466  putative metal dependent phosphohydrolase  35.5 
 
 
330 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2693  HD-GYP domain-containing protein  39.82 
 
 
319 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2752  putative metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 
333 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380843  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2242  putative metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 
333 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4783  putative metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0983875  normal  0.561862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4051  HD-GYP domain-containing protein  36.07 
 
 
449 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4311  putative metal dependent phosphohydrolase  34.66 
 
 
408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0489  HD-GYP domain-containing protein  31.42 
 
 
402 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2773  hypothetical protein  30.56 
 
 
409 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804833  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2647  metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.427362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1357  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 
399 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0373  putative metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 
410 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  30.05 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  23.21 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  29.74 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
375 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 
419 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 
399 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  27.55 
 
 
404 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  23.58 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  23.98 
 
 
393 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 
377 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 
402 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  25.52 
 
 
409 aa  59.7  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 
403 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  24.11 
 
 
395 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  29.49 
 
 
402 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 
398 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  22.73 
 
 
401 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 
446 aa  56.6  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 
431 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  27.32 
 
 
414 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0563  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  24.58 
 
 
446 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  27.18 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  26.57 
 
 
446 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  22.09 
 
 
403 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  20.44 
 
 
391 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  22.11 
 
 
400 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  22.36 
 
 
392 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1227  metal dependent phosphohydrolase  24.19 
 
 
394 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  26.04 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  23.01 
 
 
435 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  26.8 
 
 
427 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  22.11 
 
 
448 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0497  metal dependent phosphohydrolase  23.26 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  22.22 
 
 
397 aa  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  23 
 
 
439 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  19.38 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1691  metal dependent phosphohydrolase  21.94 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0771353  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  20.93 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  22.17 
 
 
350 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  37.61 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  19.31 
 
 
417 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 
448 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  20.51 
 
 
424 aa  46.6  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  20.42 
 
 
405 aa  46.2  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  23.96 
 
 
404 aa  46.2  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  21.54 
 
 
390 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0712  hypothetical protein  49.02 
 
 
72 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 
420 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  21.43 
 
 
407 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  23.47 
 
 
718 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1519  putative metal dependent phosphohydrolase  23.58 
 
 
404 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000671855  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  22.97 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
406 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  24.02 
 
 
373 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  22.44 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 
435 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  21.37 
 
 
396 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  21.82 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  20.92 
 
 
406 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2459  metal dependent phosphohydrolase  22.12 
 
 
400 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  23.47 
 
 
402 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1559  metal-dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 
698 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000474129  normal  0.225702 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  21.13 
 
 
411 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  21.13 
 
 
411 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  20.49 
 
 
401 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  20.16 
 
 
405 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 
412 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
420 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  22.03 
 
 
390 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  23.44 
 
 
375 aa  43.1  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  24.31 
 
 
420 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 
372 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  19.9 
 
 
396 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>