More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0926 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0926  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
274 aa  531  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1473  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.35 
 
 
306 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0411979  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0208  nitrate ABC transporter, permease protein, putative  40.75 
 
 
260 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.473726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
314 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.82677  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2218  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
290 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.484673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3160  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.64 
 
 
274 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.913146  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
319 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0787698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
305 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
295 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
291 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.252204  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
291 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
291 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690359  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.88 
 
 
283 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.321257  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 
287 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0673  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40 
 
 
275 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0666321  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
291 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0924  ABC transporter permease protein  39.8 
 
 
258 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4879  putative ABC transporter, permease protein  39.7 
 
 
263 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
288 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
253 aa  145  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
314 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
252 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
290 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0425684  normal  0.379949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6545  ABC transporter permease  36.71 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.276106 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  33.77 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.42 
 
 
254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
253 aa  135  9e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.1 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.93 
 
 
279 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  33.78 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3526  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.09 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.471487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
273 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.18 
 
 
271 aa  128  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  0.0459168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 
269 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.406887  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1704  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.08 
 
 
311 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.28 
 
 
294 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4395  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.55 
 
 
277 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4458  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.55 
 
 
277 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.698055  normal  0.534513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.45 
 
 
293 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
255 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
239 aa  123  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6460  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 
297 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16930  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  34.19 
 
 
322 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.327  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4471  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  30.15 
 
 
297 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.5689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  32.06 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  32.06 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0640  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.15 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  32.06 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  32.91 
 
 
287 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  31.92 
 
 
261 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  31.78 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4958  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.5 
 
 
285 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.165118 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
253 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
280 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
283 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.57 
 
 
283 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
283 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
283 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
285 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.57 
 
 
283 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2837  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.39 
 
 
266 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.115716  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
275 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4495  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.46 
 
 
285 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  33.33 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2205  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.05 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1439  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.4 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.062597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5011  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.09 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312092  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3750  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  33.76 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  36.6 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  32.64 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  34.22 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2337  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  32.99 
 
 
282 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  33.78 
 
 
275 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2104  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  34.24 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0291571  normal  0.0240092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0329  nitrate transport permease  36.16 
 
 
300 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2273  nitrate transport permease  32.62 
 
 
299 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
269 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
269 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0276  nitrate transport permease  34.46 
 
 
303 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4571  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 
280 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  33.78 
 
 
275 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1026  nitrate transport permease  28.97 
 
 
279 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.174596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>