50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0802 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  587  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  58.8 
 
 		 304 aa  313  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0854  hypothetical protein  56.66 
 
 		 314 aa  311  7.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  41.3 
 
 		 295 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  41.11 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  41.33 
 
 		 284 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  38.95 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0320  hypothetical protein  38.83 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2143  putative signal peptide  31.99 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00697757  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4806  putative signal peptide  31.21 
 
 		 371 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6201  putative signal peptide  31.01 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1696  putative signal peptide  33.46 
 
 		 331 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109221  normal  0.128505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2015  putative signal peptide  33.46 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1122  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.33 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4345  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  30.15 
 
 		 323 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2592  nucleoside-binding outer membrane protein  26.53 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3214  hypothetical protein  27.04 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2061  hypothetical protein  25.9 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377707 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  27.07 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2064  hypothetical protein  27.47 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  24.32 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2062  hypothetical protein  25.26 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335089  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1700  hypothetical protein  24.47 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  22.48 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  23.17 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  23.17 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3617  hypothetical protein  25.21 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0375428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3855  hypothetical protein  23.95 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0979699  normal  0.713498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1698  hypothetical protein  22.26 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  24.79 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3697  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  24.39 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  22.88 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  23.24 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  27.11 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  24.79 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4291  hypothetical protein  23.11 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1577  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  23.11 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0413  hypothetical protein  24.14 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.977542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4054  hypothetical protein  24.83 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0462  hypothetical protein  24.3 
 
 		 250 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3073  hypothetical protein  25.21 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4508  hypothetical protein  24.31 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3402  hypothetical protein  23.13 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0245  hypothetical protein  23.33 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02060  hypothetical protein  23.33 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520939  normal  0.571612 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0461  hypothetical protein  23.86 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0492  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  23.69 
 
 		 250 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000160917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0489  hypothetical protein  23.69 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000981799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0468  hypothetical protein  23.69 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000281501  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3851  hypothetical protein  23.69 
 
 		 250 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0452291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>