27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1122 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2015  putative signal peptide  94.86 
 
 		 331 aa  636    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1122  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 		 331 aa  670    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1696  putative signal peptide  94.56 
 
 		 331 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109221  normal  0.128505 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6201  putative signal peptide  81.07 
 
 		 338 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2143  putative signal peptide  59.33 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00697757  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4345  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  52.25 
 
 		 323 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4806  putative signal peptide  51.62 
 
 		 371 aa  292  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2064  hypothetical protein  33.42 
 
 		 364 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  32.88 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  33.57 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2061  hypothetical protein  34.06 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2062  hypothetical protein  32.81 
 
 		 364 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335089  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  30.54 
 
 		 304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0854  hypothetical protein  30.93 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  31.62 
 
 		 277 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  32.33 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0320  hypothetical protein  31.2 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  30.57 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  25.21 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  24.27 
 
 		 265 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  23.66 
 
 		 260 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3888  hypothetical protein  24.37 
 
 		 262 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00561363  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  23.53 
 
 		 265 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  23.43 
 
 		 265 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  23.28 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3976  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  23.21 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000541292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  23.28 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>