29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6201 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6201  putative signal peptide  100 
 
 		 338 aa  685    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1696  putative signal peptide  81.66 
 
 		 331 aa  549  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109221  normal  0.128505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2015  putative signal peptide  81.36 
 
 		 331 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1122  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  81.07 
 
 		 331 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2143  putative signal peptide  62.8 
 
 		 339 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00697757  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4345  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  52.82 
 
 		 323 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4806  putative signal peptide  50 
 
 		 371 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  34.67 
 
 		 284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  34.88 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2061  hypothetical protein  35.05 
 
 		 364 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2062  hypothetical protein  33.23 
 
 		 364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335089  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  32.22 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0854  hypothetical protein  32.22 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  33.19 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0320  hypothetical protein  32.77 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  33.58 
 
 		 286 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  32.52 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4879  hypothetical protein  24.81 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000399602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0187  hypothetical protein  24.69 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1576  nucleoside-binding outer membrane protein-like protein  24.24 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4293  hypothetical protein  24.62 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3856  hypothetical protein  24.61 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00178481  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01608  hypothetical protein  21.67 
 
 		 259 aa  47  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0177  hypothetical protein  23.85 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0198  nucleoside-specific channel-forming protein Tsx  23.9 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1804  hypothetical protein  22.66 
 
 		 261 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0626239  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3671  hypothetical protein  22.27 
 
 		 261 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3618  hypothetical protein  24.06 
 
 		 260 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.115342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>