18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2064 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2061  hypothetical protein  88.74 
 
 		 364 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2062  hypothetical protein  89.56 
 
 		 364 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335089  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2064  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  753    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2015  putative signal peptide  32.88 
 
 		 331 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1696  putative signal peptide  32.88 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109221  normal  0.128505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1122  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  33.42 
 
 		 331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6201  putative signal peptide  33.33 
 
 		 338 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2143  putative signal peptide  32.64 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00697757  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4345  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  30.57 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4806  putative signal peptide  29.07 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02890  hypothetical protein  27.44 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.585077  hitchhiker  0.00223005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0640  hypothetical protein  30.74 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0320  hypothetical protein  28.03 
 
 		 277 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1772  hypothetical protein  28.12 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.807545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0802  hypothetical protein  27.47 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0854  hypothetical protein  26.36 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0870  hypothetical protein  26.36 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3454  hypothetical protein  30.28 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0269965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>