22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1405 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1405  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1398  putative PAS/PAC sensor protein  56.45 
 
 		 451 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1412  putative PAS/PAC sensor protein  55.88 
 
 		 596 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2764  putative PAS/PAC sensor protein  58.21 
 
 		 593 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  50.7 
 
 		 468 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  36.25 
 
 		 490 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  42.19 
 
 		 432 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  40.32 
 
 		 479 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 		 925 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  40.98 
 
 		 449 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  40.98 
 
 		 439 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 445 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 535 aa  47.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  43.14 
 
 		 558 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  36.07 
 
 		 690 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  35.21 
 
 		 589 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 559 aa  42.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  43.64 
 
 		 715 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 		 477 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  29.31 
 
 		 821 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1421  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 588 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0454368  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  33.85 
 
 		 605 aa  40.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>