More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1223 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  100 
 
 
398 aa  819    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  68.27 
 
 
399 aa  565  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  63.29 
 
 
395 aa  535  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  62.6 
 
 
397 aa  532  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  61.58 
 
 
397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  61.32 
 
 
397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  61.58 
 
 
397 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  60.2 
 
 
397 aa  504  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  59.29 
 
 
397 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  57.91 
 
 
397 aa  483  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  58.93 
 
 
399 aa  475  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  46.27 
 
 
397 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  39.19 
 
 
407 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  38.07 
 
 
407 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  38.27 
 
 
414 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  39.64 
 
 
419 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  35.71 
 
 
408 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  32.72 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  34.28 
 
 
397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  33.76 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  35.82 
 
 
405 aa  196  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  33.6 
 
 
398 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  33.43 
 
 
400 aa  189  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  31.75 
 
 
396 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  32.25 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  33.59 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  31.95 
 
 
397 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  31.69 
 
 
397 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  30.63 
 
 
398 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  33.96 
 
 
390 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  30.75 
 
 
397 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  34.18 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  34.18 
 
 
396 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  30.15 
 
 
402 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  30.08 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  31.36 
 
 
388 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  30.65 
 
 
385 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  31.83 
 
 
389 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  30.85 
 
 
388 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  30.33 
 
 
394 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  29.66 
 
 
390 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  29.35 
 
 
398 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  32.57 
 
 
380 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  32.57 
 
 
380 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  32.05 
 
 
380 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  29.08 
 
 
376 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  26.37 
 
 
355 aa  100  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  31.27 
 
 
376 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  25.75 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  26.82 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  25.58 
 
 
351 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  25.58 
 
 
351 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  28.66 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  23.74 
 
 
361 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  26.8 
 
 
359 aa  92  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  24.23 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  26.26 
 
 
371 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  25.53 
 
 
356 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  26.8 
 
 
359 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  25.33 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  28.57 
 
 
353 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  31.11 
 
 
371 aa  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  26.32 
 
 
359 aa  89.4  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.61 
 
 
353 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.61 
 
 
353 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  31.14 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.61 
 
 
353 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.61 
 
 
353 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.61 
 
 
353 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  27.61 
 
 
353 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.61 
 
 
353 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  25.26 
 
 
356 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.61 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  23.92 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  26.01 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  26.89 
 
 
357 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  26.82 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  27.27 
 
 
353 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  25 
 
 
354 aa  87  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  23.78 
 
 
356 aa  87  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  25.26 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  24.68 
 
 
359 aa  87  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0663  peptidase M24  30.68 
 
 
387 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  26.59 
 
 
353 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0992  peptidase M24  21.71 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  26.49 
 
 
365 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  31.02 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  26.49 
 
 
365 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  25.17 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  24.02 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  23.47 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  26.49 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  23.47 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.84 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  27.04 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  25.5 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  29.31 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  29.55 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  28.03 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  35.62 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.798559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>