79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0783 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 
254 aa  520  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  66.39 
 
 
249 aa  342  5e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  70.14 
 
 
227 aa  333  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  58.09 
 
 
245 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  62.26 
 
 
217 aa  294  9e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  47.7 
 
 
244 aa  224  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  44.8 
 
 
251 aa  209  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.56 
 
 
255 aa  205  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  44.49 
 
 
256 aa  201  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  44.49 
 
 
260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  47.79 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  42.8 
 
 
251 aa  192  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  43.78 
 
 
250 aa  177  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.01 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.57 
 
 
248 aa  155  7e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.09 
 
 
248 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40.09 
 
 
248 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  40.27 
 
 
252 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  41.04 
 
 
251 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  38.67 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.25 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.17 
 
 
241 aa  143  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  38.5 
 
 
256 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  37.56 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  36.24 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  36.53 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  35.17 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  38.37 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.22 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.93 
 
 
362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  36.91 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.21 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  37.82 
 
 
388 aa  124  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.21 
 
 
363 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  33.02 
 
 
269 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  32.95 
 
 
257 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  40.1 
 
 
291 aa  122  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  37.95 
 
 
427 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  38.91 
 
 
431 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.84 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  33.78 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  36.62 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  27.31 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  35.22 
 
 
439 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  34.86 
 
 
431 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.36 
 
 
423 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.05 
 
 
425 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  35.82 
 
 
450 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  33.78 
 
 
271 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.52 
 
 
463 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  35.27 
 
 
251 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.4 
 
 
526 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.33 
 
 
446 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.74 
 
 
448 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.48 
 
 
442 aa  99  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  35 
 
 
387 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
283 aa  95.9  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  33.48 
 
 
351 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  44.35 
 
 
264 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.91 
 
 
430 aa  93.6  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  33.48 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  33.48 
 
 
289 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  33.73 
 
 
458 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  28.95 
 
 
259 aa  88.6  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.99 
 
 
471 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.73 
 
 
455 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.73 
 
 
455 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  32.44 
 
 
243 aa  85.5  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.49 
 
 
461 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  35.96 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  31.86 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.99 
 
 
448 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  32.88 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  24.3 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1147  hypothetical protein  32 
 
 
243 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  31.03 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  39.66 
 
 
273 aa  58.9  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>