More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0256 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0256  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.327339  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2433  hydrolase  66.29 
 
 
268 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2066  hydrolase  60.89 
 
 
280 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2312  haloacid dehalogenase-like hydrolase  55.68 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0556  hypothetical protein  47.78 
 
 
274 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0176824 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1901  haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.69 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0708  potassium/copper-transporting ATPase  36.9 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281693  normal  0.585181 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0375  hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  124  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0914  hydrolase  31.6 
 
 
263 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.562334  normal  0.776426 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1767  adenosinetriphosphatase  31.23 
 
 
263 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1030  hydrolase  31.6 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0946  hydrolase  30.86 
 
 
276 aa  113  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.696714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
798 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  40.48 
 
 
723 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
797 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
699 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13063  P-ATPase family transporter: copper ion; heavy metal transporting P-type ATPase-like protein  38.55 
 
 
763 aa  63.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0193  copper-transporting P-type ATPase  35.63 
 
 
709 aa  63.2  0.000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0946171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0451  heavy metal-transporting ATPase family protein  29.96 
 
 
673 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.390331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  31.5 
 
 
772 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  37.21 
 
 
815 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
637 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
890 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
780 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1813  copper-translocating P-type ATPase  37.65 
 
 
800 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
777 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
817 aa  60.1  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
715 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  40.7 
 
 
691 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0705  copper-translocating P-type ATPase  37.11 
 
 
779 aa  59.3  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  40.48 
 
 
835 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
706 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
846 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2686  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
656 aa  59.3  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682129  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  38.37 
 
 
795 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  38.37 
 
 
796 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  36.05 
 
 
697 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  36.05 
 
 
697 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  36.05 
 
 
697 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
798 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
798 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  41.25 
 
 
806 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  37.21 
 
 
795 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  41.03 
 
 
751 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
813 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 
758 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  37.36 
 
 
697 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0564  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
789 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  37.36 
 
 
707 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1836  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
808 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.048394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.21 
 
 
739 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1377  heavy metal translocating P-type ATPase subfamily protein  40.48 
 
 
691 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1621  copper-translocating P-type ATPase  34.09 
 
 
761 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.996333  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 
806 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
821 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1548  copper-translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
813 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0486383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  38.68 
 
 
647 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  35.78 
 
 
802 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  38.37 
 
 
811 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
762 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  40.48 
 
 
798 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  35.78 
 
 
802 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  36.78 
 
 
744 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  39.22 
 
 
712 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  38.96 
 
 
819 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
752 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  29.29 
 
 
799 aa  56.6  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1911  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 
839 aa  56.2  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0727  heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 
792 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000426608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  35.16 
 
 
885 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  39.08 
 
 
790 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  35.63 
 
 
838 aa  55.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
807 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  40.66 
 
 
792 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
778 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
761 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  38.37 
 
 
857 aa  55.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
767 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  38.04 
 
 
641 aa  55.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
796 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0594  cation transport ATPase  31.29 
 
 
775 aa  55.5  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  35.63 
 
 
805 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  37.61 
 
 
826 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  35.35 
 
 
782 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 
743 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  38.1 
 
 
752 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  39.56 
 
 
814 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  39.56 
 
 
814 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  36.9 
 
 
746 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1568  heavy metal translocating P-type ATPase  36.45 
 
 
758 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
806 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  34.65 
 
 
1022 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 
639 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
818 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  36.05 
 
 
742 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0552  cadmium-translocating P-type ATPase  32.94 
 
 
645 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1262  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 
686 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37271  normal  0.0359143 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3161  copper-translocating P-type ATPase  24.69 
 
 
795 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 
816 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  34.88 
 
 
796 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>