80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8376 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 136 aa  261  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  51.22 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1582  hypothetical protein  48.09 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.447037 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3698  hypothetical protein  39.83 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.451428 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4399  transposase IS3/IS911 family protein  39.83 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134241  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1804  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4110  hypothetical protein  38.14 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3198  transposase IS3/IS911 family protein  37.29 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  39.84 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  39.84 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  35.92 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  35.92 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  35.92 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  44.58 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  35.62 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  51.32 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  47.5 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  47.5 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  47.5 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  32.5 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  44.3 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  37.31 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  38.81 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4915  transposase IS3/IS911 family protein  30.94 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.269908 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4930  hypothetical protein  54.35 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.527295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  47.56 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  53.85 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  53.85 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  46.34 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  38.33 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  27.19 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  40.32 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  40.32 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  40.32 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  40.32 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  37.88 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  40.32 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  40.32 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  40.32 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  40.32 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  40.32 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  44.44 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  40.32 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  44.44 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4610  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695949  normal  0.162062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  42 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  35.94 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  27.45 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  32.86 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  30.51 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  32 
 
 		 224 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  26.47 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  29 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  29 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  29 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  29 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  29 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  29 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  29 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  29.77 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>