267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3140 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  83.49 
 
 		 218 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1277  isochorismatase hydrolase  84.19 
 
 		 217 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5472  isochorismatase hydrolase  78.8 
 
 		 217 aa  357  7e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  71.96 
 
 		 217 aa  335  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0759  isochorismatase hydrolase  75.59 
 
 		 225 aa  323  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  68.54 
 
 		 218 aa  312  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0322  isochorismatase hydrolase  58.77 
 
 		 221 aa  259  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0166025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4273  isochorismatase hydrolase  57.21 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  54.41 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  54.81 
 
 		 220 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  50.74 
 
 		 211 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  50.74 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  49.25 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  51.49 
 
 		 216 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  50.5 
 
 		 216 aa  208  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  46.77 
 
 		 213 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  49.5 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  47.32 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  47.5 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  47.5 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  47.5 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  47.5 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  47.5 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  47.5 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  47.5 
 
 		 214 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29240  putative hydrolase  48 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  47.06 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0263508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2662  isochorismatase hydrolase  46.34 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0186  hypothetical protein  46.83 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348065  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1666  isochorismatase hydrolase  49.52 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  47.24 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3973  putative hydrolase  47.5 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.289869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  45.89 
 
 		 216 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7008  isochorismatase hydrolase  46.6 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  46.38 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0188  isochorismatase hydrolase  45.89 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1487  isochorismatase hydrolase  46.12 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6342  isochorismatase hydrolase  46.12 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4848  isochorismatase hydrolase  46.83 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3504  isochorismatase hydrolase  47.78 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1270  isochorismatase hydrolase  46.34 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5810  isochorismatase hydrolase  46.34 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209383  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5594  isochorismatase hydrolase  46.34 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1304  isochorismatase hydrolase  46.34 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1371  isochorismatase hydrolase  45.85 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1558  isochorismatase hydrolase  47.78 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4075  isochorismatase hydrolase  48.53 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4727  isochorismatase hydrolase  46.77 
 
 		 232 aa  193  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5311  isochorismatase hydrolase  45.37 
 
 		 228 aa  193  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0911  isochorismatase hydrolase  45.85 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1393  isochorismatase hydrolase  45.85 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.248443  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4536  isochorismatase hydrolase  44.39 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0687  isochorismatase superfamily hydrolase  46.08 
 
 		 284 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0594  isochorismatase superfamily hydrolase  46.08 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1914  isochorismatase hydrolase  46.5 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1985  isochorismatase superfamily hydrolase  46.08 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0242  putative hydrolase protein  45.37 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2382  isochorismatase hydrolase  44.29 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1233  isochorismatase hydrolase  45.1 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1916  isochorismatase hydrolase  48.63 
 
 		 204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  43 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  40.5 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  42.29 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  40.1 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  40.8 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  41.29 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  39.3 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  40.8 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2192  isochorismatase hydrolase  36 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3473  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0622536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4314  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4052  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4681  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 213 aa  131  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01788  hypothetical protein  35.5 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  0.622692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0242  isochorismatase  35.18 
 
 		 347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540503  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4267  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 213 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.450558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4572  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333323  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1179  isochorismatase hydrolase  34.2 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  0.599787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1858  amidase  37.99 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000146325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  32.42 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  34.46 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  33.7 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  31.66 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3745  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  32.96 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  32.96 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  32.4 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2746  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>