74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2731 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2731  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 
272 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.036458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1269  purine phosphorylase family 1  80.95 
 
 
273 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4539  purine phosphorylases family protein 1  59.61 
 
 
268 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0773482  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4378  purine phosphorylases family protein 1  59.22 
 
 
268 aa  279  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.340466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0965  purine phosphorylase family 1  58.04 
 
 
292 aa  266  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470514  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4454  purine phosphorylase family 1  58.7 
 
 
274 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4070  purine or other phosphorylase family 1  48.06 
 
 
265 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2578  purine or other phosphorylase family 1  41.41 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1043  uridine phosphorylase  34.81 
 
 
233 aa  86.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1429  purine phosphorylases family protein 1  32.75 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000543791  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0955  phosphorylase, Pnp/Udp family  33.33 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0510178  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0551  phosphorylase, Pnp/Udp family  39.39 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000889574 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0591  phosphorylase, Pnp/Udp family, putative  30 
 
 
256 aa  79  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000246027  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1115  purine or other phosphorylase family 1  34.06 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000837521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0281  purine phosphorylase family 1  30.5 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00127495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1527  S-methyl-5-thioadenosine phosphorylase  30.41 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0020  purine phosphorylase family 1  25.43 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1714  purine phosphorylase family 1  33.96 
 
 
253 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0567  Purine-nucleoside phosphorylase  28.88 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0544  purine or other phosphorylase family 1  22.86 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41980  phosphorylase  29.49 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1978  purine nucleoside phosphorylase  26.92 
 
 
234 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0545  purine phosphorylase family 1  28.07 
 
 
244 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0603  purine phosphorylase family 1  30.32 
 
 
222 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0004  uridine phosphorylase  29.58 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000523211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3654  uridine phosphorylase  28.17 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  25.54 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2962  Purine-nucleoside phosphorylase  29.25 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.266203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0910  purine or other phosphorylase family 1  30.67 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303015  normal  0.357288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1081  purine or other phosphorylase family 1  22.62 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0754  uridine phosphorylase  23.96 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0818347  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2738  purine or other phosphorylase family 1  27.43 
 
 
272 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1005  purine nucleoside phosphorylase  25.48 
 
 
236 aa  49.3  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1572  purine phosphorylases family protein 1  28.57 
 
 
222 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06138  hypothetical protein  26.79 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1028  purine nucleoside phosphorylase  23.08 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.263223  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3488  purine phosphorylase family protein 1  27.27 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0963  purine or other phosphorylase family 1  22.44 
 
 
271 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0550  purine or other phosphorylase family 1  28.07 
 
 
244 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2072  purine or other phosphorylase family 1  24 
 
 
240 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3794  purine phosphorylases family protein 1  28.07 
 
 
244 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0304  purine phosphorylase family 1  20.5 
 
 
262 aa  46.6  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  26.75 
 
 
235 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2504  uridine phosphorylase  20.95 
 
 
259 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  26.75 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  26.75 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  26.75 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  26.75 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  26.75 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  26.75 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  26.75 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  26.75 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  26.75 
 
 
235 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2464  purine or other phosphorylase family 1  23.9 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4297  uridine phosphorylase, putative  24.43 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0976  purine nucleoside phosphorylase  23.08 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392055 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  24.71 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2318  purine or other phosphorylase family 1  24.56 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0663  purine nucleoside phosphorylase  27.86 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0799  purine nucleoside phosphorylase  26.98 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.467388  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  27.84 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0126  purine phosphorylases family protein 1  25.66 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1513  purine-nucleoside phosphorylase  25.16 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0821603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3546  purine nucleoside phosphorylase  24.2 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.799796  hitchhiker  0.000820133 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0288  purine nucleoside phosphorylase  23.72 
 
 
238 aa  42.7  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.324122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0828  purine-nucleoside phosphorylase  28.26 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2812  purine nucleoside phosphorylase  24.2 
 
 
236 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0651432  unclonable  0.00000308017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3624  purine nucleoside phosphorylase  24.84 
 
 
239 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1044  purine nucleoside phosphorylase  21.79 
 
 
236 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1105  purine nucleoside phosphorylase  21.79 
 
 
236 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3495  purine nucleoside phosphorylase  24.84 
 
 
239 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1040  purine nucleoside phosphorylase  21.79 
 
 
236 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.540297  hitchhiker  0.00000698922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2864  purine nucleoside phosphorylase  23.08 
 
 
236 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.304471  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2420  purine nucleoside phosphorylase  29.3 
 
 
236 aa  42  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>