63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3296 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3296  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 92 aa  194  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2095  SpoIIAA family protein  51.06 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2367  SpoIIAA family protein  51.06 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00979283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2250  SpoIIAA family protein  51.06 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0929846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2107  SpoIIAA family protein  50 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2118  SpoIIAA family protein  45.74 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2221  anti-sigma-factor antagonist  45.74 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1878  anti-sigma-factor antagonist  45.74 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838395  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2096  anti-sigma-factor antagonist  45.74 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.18 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1992  anti-sigma-factor antagonist  41.77 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3441  anti-sigma-factor antagonist  36.36 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  35.29 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  36.25 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  34.12 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  34.12 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  32.94 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  37.18 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1038  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.09 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  32.94 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3533  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.68 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  34.44 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  37.18 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.62 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  31.4 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2225  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.999685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.34 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2208  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.58 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1080  anti-sigma-factor antagonist  32.91 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1523  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  30.34 
 
 		 336 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.229071  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0958  anti-sigma-factor antagonist  31.65 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  27.85 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1390  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.12 
 
 		 96 aa  44.3  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  23.08 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  27.85 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1200  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.162104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1593  anti-sigma-factor antagonist  30.38 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2186  anti-sigma-factor antagonist  31.17 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0946  anti-sigma F factor antagonist, putative  27.27 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  23.46 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0441  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.18 
 
 		 115 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0945  anti-anti-sigma regulatory factor  30.91 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959965  hitchhiker  0.00175597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  21.98 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  28.41 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  23.6 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  27.08 
 
 		 351 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  22.73 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2767  anti-sigma-factor antagonist  26.79 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314327  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1395  anti-anti-sigma factor, putative  29.11 
 
 		 256 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.392973  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0411  hypothetical protein  29 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.368048  normal  0.907384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  24 
 
 		 250 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>