More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3102 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.49 
 
 		 199 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.97 
 
 		 199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  57.95 
 
 		 199 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  57.95 
 
 		 199 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.57 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  54.08 
 
 		 199 aa  245  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  55.9 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  55.9 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  55.9 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  55.9 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  57.75 
 
 		 196 aa  238  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  58.29 
 
 		 200 aa  237  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  55.9 
 
 		 198 aa  237  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  57.75 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  57.75 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  56.68 
 
 		 196 aa  235  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  57.22 
 
 		 196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  56.68 
 
 		 196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  57.22 
 
 		 196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  57.22 
 
 		 196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  56.52 
 
 		 203 aa  234  8e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  53.37 
 
 		 205 aa  228  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  55.85 
 
 		 200 aa  226  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  53.4 
 
 		 198 aa  224  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  55.61 
 
 		 202 aa  224  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  51.79 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  53.23 
 
 		 196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  53.76 
 
 		 196 aa  217  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  53.23 
 
 		 196 aa  217  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  53.23 
 
 		 196 aa  217  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  51.53 
 
 		 222 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  55.19 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  45.11 
 
 		 204 aa  184  5e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  43.78 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  47.06 
 
 		 171 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  47.06 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  47.06 
 
 		 175 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  45 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  42.67 
 
 		 157 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  44.59 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  41.18 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  44.38 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  42 
 
 		 154 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1631  carbonic anhydrase  44.22 
 
 		 160 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.947333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  41.82 
 
 		 172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  41.29 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  41.4 
 
 		 168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  42.24 
 
 		 173 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  40.61 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  40.94 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  41.51 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.45 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0961  ferripyochelin binding protein  45.93 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.61 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  41.21 
 
 		 172 aa  124  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  40.99 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  40.51 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  35.76 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4038  carbonic anhydrase  40 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820028  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1622  ferripyochelin binding protein  37.11 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000492674  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  40 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2793  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.38 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000628922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  37.13 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  36.59 
 
 		 172 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  38.04 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0660  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.34 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  42.21 
 
 		 183 aa  121  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0023  hypothetical protein  38.41 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.727004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  38.27 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  36.42 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  42.28 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0612  hexapaptide repeat-containing transferase  39.74 
 
 		 163 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  39.64 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  40.38 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  36.36 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  36.42 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1929  hexapaptide repeat-containing transferase  40.24 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000963233  hitchhiker  0.00946276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  34.71 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1903  hexapeptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 		 167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000422346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  36.97 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  34.55 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1632  hypothetical protein  39.41 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.096808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1599  acetyltransferase/acyltransferase  35.98 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  35.76 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  41.1 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06060  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  42.58 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  40.76 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2773  hypothetical protein  35.44 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000332346  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0768  ferripyochelin binding protein (fbp)  38.99 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  37.5 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  36.9 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  34.55 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1450  hexapaptide repeat-containing transferase  40.13 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.292844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1692  hexapaptide repeat-containing transferase  41.56 
 
 		 163 aa  115  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  39.24 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  37.5 
 
 		 174 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2168  hexapaptide repeat-containing transferase  40.76 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  42.04 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>