More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4773 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5159  alcohol dehydrogenase  98.82 
 
 
338 aa  658    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.821329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4773  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4859  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1877  alcohol dehydrogenase  45.78 
 
 
364 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115652 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000625  zinc-binding dehydrogenase  42.98 
 
 
352 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2276  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.41 
 
 
388 aa  258  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0310  alcohol dehydrogenase  42.03 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3714  alcohol dehydrogenase  42.03 
 
 
358 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0305  alcohol dehydrogenase  41.45 
 
 
358 aa  243  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0851572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2325  alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 
385 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0442784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.35 
 
 
385 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2333  alcohol dehydrogenase  41.35 
 
 
385 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.69 
 
 
387 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13758  dehydrogenase  40.05 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0782561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5762  alcohol dehydrogenase  39.78 
 
 
386 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117069  normal  0.104571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7154  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
351 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0462629  normal  0.0194652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 
340 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  31.16 
 
 
335 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 
337 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.21 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  29.25 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.69 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  30.39 
 
 
363 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  30.66 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.03 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.34 
 
 
350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  29.56 
 
 
360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 
350 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
354 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 
362 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.49 
 
 
354 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  29.83 
 
 
362 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.89 
 
 
350 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.89 
 
 
350 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  29.56 
 
 
362 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.77 
 
 
354 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  28.89 
 
 
350 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.89 
 
 
350 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.89 
 
 
350 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  31.49 
 
 
365 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.89 
 
 
350 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  28.89 
 
 
350 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  28.89 
 
 
350 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.89 
 
 
350 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
354 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  28.89 
 
 
350 aa  123  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  32.12 
 
 
364 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
354 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
373 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3300  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
373 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.5 
 
 
373 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.95 
 
 
348 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  32.5 
 
 
373 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5057  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.31 
 
 
340 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.61 
 
 
368 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.51 
 
 
373 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  31.6 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.02 
 
 
350 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
373 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  29.94 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  31.56 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.48 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  28.21 
 
 
342 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.23 
 
 
343 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.72 
 
 
349 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.23 
 
 
343 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.57 
 
 
350 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.35 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.43 
 
 
341 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 
341 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  28.97 
 
 
345 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  27.14 
 
 
341 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.97 
 
 
351 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  29.43 
 
 
357 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
348 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.49 
 
 
357 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.69 
 
 
336 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.44 
 
 
346 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  28.73 
 
 
343 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.16 
 
 
341 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1659  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
339 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.21 
 
 
356 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0912  threonine dehydrogenase related Zn-dependent dehydrogenase  27.5 
 
 
349 aa  106  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
343 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  28.14 
 
 
353 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.14 
 
 
345 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
345 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  25.56 
 
 
353 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  31.87 
 
 
342 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 
347 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07590  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  28.85 
 
 
357 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  27.75 
 
 
337 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  27.99 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  24.51 
 
 
340 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.69 
 
 
343 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 
373 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>