105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4212 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  658    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  99.33 
 
 
299 aa  583  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1990  hypothetical protein  86.58 
 
 
298 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3952  hypothetical protein  63.64 
 
 
289 aa  347  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3493  Protein of unknown function DUF2236  57.76 
 
 
288 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62640  hypothetical protein  43.46 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3367  hypothetical protein  40.64 
 
 
318 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3347  hypothetical protein  40.14 
 
 
313 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416486  hitchhiker  0.000649689 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3408  hypothetical protein  40.28 
 
 
318 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3402  hypothetical protein  40.28 
 
 
318 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.784481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2352  hypothetical protein  40.28 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0265  hypothetical protein  40.28 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1127  hypothetical protein  40.28 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2531  hypothetical protein  40.28 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0614  hypothetical protein  39.46 
 
 
313 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.328106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4702  hypothetical protein  43.27 
 
 
289 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107996  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1246  hypothetical protein  43.5 
 
 
296 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5451  hypothetical protein  42.86 
 
 
293 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0654  hypothetical protein  41.3 
 
 
317 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.938218  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4568  hypothetical protein  42.86 
 
 
289 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4703  hypothetical protein  42.86 
 
 
289 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.928187  hitchhiker  0.000667677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0606  hypothetical protein  39.58 
 
 
314 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237281  normal  0.662738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2697  hypothetical protein  43.9 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463254  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0730  hypothetical protein  42.86 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3773  hypothetical protein  40.55 
 
 
317 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0825  hypothetical protein  41.63 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0580  hypothetical protein  40.22 
 
 
314 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1495  hypothetical protein  40.65 
 
 
303 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0650683  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0204  hypothetical protein  40.61 
 
 
317 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0687  hypothetical protein  40.61 
 
 
317 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1401  hypothetical protein  39.6 
 
 
290 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0958  hypothetical protein  37.76 
 
 
288 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5085  hypothetical protein  42.11 
 
 
279 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5234  hypothetical protein  42.11 
 
 
310 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.497953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3596  hypothetical protein  39 
 
 
288 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4155  hypothetical protein  40.08 
 
 
298 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4267  hypothetical protein  40.08 
 
 
298 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.584453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2180  hypothetical protein  40.76 
 
 
322 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.926888  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05300  hypothetical protein  39.29 
 
 
298 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4467  hypothetical protein  49.71 
 
 
311 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129838  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  42.98 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0689  hypothetical protein  39.91 
 
 
296 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0424  hypothetical protein  38.98 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1651  hypothetical protein  35.62 
 
 
286 aa  136  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1198  hypothetical protein  37.76 
 
 
303 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12300  hypothetical protein  36.55 
 
 
298 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8395  hypothetical protein  41.31 
 
 
305 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2430  Protein of unknown function DUF2236  40.28 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128391  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03038  hypothetical protein  44.57 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0695  hypothetical protein  35.98 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4913  hypothetical protein  28.92 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0557  hypothetical protein  37.31 
 
 
287 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  33.93 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  33.48 
 
 
299 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6802  hypothetical protein  35.18 
 
 
282 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3134  hypothetical protein  35.16 
 
 
302 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0152126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2831  hypothetical protein  34.39 
 
 
281 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323303  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  32.23 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  35.02 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0614  hypothetical protein  37.67 
 
 
256 aa  89.7  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5110  hypothetical protein  29.3 
 
 
332 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.999627  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  26.53 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2225  hypothetical protein  37.38 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.0159378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1243  hypothetical protein  29.46 
 
 
336 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3377  Protein of unknown function DUF2236  28.41 
 
 
364 aa  85.9  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  28.11 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7872  hypothetical protein  29.03 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0594  Protein of unknown function DUF2236  29.03 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0775081  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0956  hypothetical protein  28.74 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0974  hypothetical protein  28.74 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0977  hypothetical protein  28.63 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3751  hypothetical protein  30.43 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  31.36 
 
 
267 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  44.34 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0552  hypothetical protein  29.65 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.345674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  28.5 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6880  hypothetical protein  31.61 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1266  Protein of unknown function DUF2236  31.14 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.612813  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  33.57 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2160  hypothetical protein  31.6 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0910299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5406  Protein of unknown function DUF2236  37.5 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  33.96 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  31.75 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  34.38 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  30.27 
 
 
276 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  25.23 
 
 
261 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  26.89 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  33.09 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2947  hypothetical protein  31.88 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.985948  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0685  hypothetical protein  24.9 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0698  hypothetical protein  24.9 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0678  hypothetical protein  28.91 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433227  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  27.62 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  37 
 
 
271 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0854  hypothetical protein  30.84 
 
 
309 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469487  normal  0.0738562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  28.84 
 
 
257 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0060  hypothetical protein  31.82 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  26.29 
 
 
312 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>