More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0936 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0936  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0954  hypothetical protein  93.26 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119757  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3430  Integrase catalytic region  74.14 
 
 		 309 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4663  Integrase catalytic region  74.14 
 
 		 309 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4701  Integrase catalytic region  74.14 
 
 		 309 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4732  Integrase catalytic region  74.14 
 
 		 309 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2615  Integrase catalytic region  74.14 
 
 		 309 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2169  Integrase catalytic region  74.14 
 
 		 309 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3614  Integrase catalytic region  74.14 
 
 		 309 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2811  Integrase catalytic region  74.14 
 
 		 309 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.675485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2446  Integrase catalytic region  68.25 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000102431  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1220  Integrase catalytic region  78.85 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1224  Integrase catalytic region  78.85 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.401317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2895  Integrase catalytic region  73.68 
 
 		 312 aa  81.3  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3301  Integrase catalytic region  73.68 
 
 		 312 aa  81.3  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2523  Integrase catalytic region  76.92 
 
 		 312 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011837  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  65.45 
 
 		 288 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2788  integrase catalytic subunit  58.73 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5444  integrase catalytic subunit  58.73 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.724901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3221  integrase catalytic subunit  58.73 
 
 		 375 aa  68.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0559107  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  55.17 
 
 		 308 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1639  integrase catalytic subunit  55.17 
 
 		 189 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1592  integrase catalytic subunit  64 
 
 		 250 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2753  integrase catalytic subunit  64 
 
 		 253 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3565  integrase catalytic subunit  64 
 
 		 250 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5582  integrase catalytic subunit  60 
 
 		 304 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0423164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5587  integrase catalytic subunit  60 
 
 		 304 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5653  integrase catalytic subunit  60 
 
 		 304 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  53.57 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  53.57 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  53.57 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  51.79 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  51.79 
 
 		 301 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  51.79 
 
 		 301 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  50.88 
 
 		 244 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  51.79 
 
 		 291 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  51.79 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  51.79 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  51.79 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  51.79 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  51.79 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  48.33 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0380  Integrase catalytic region  54.55 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  51.79 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1404  Integrase catalytic region  54.55 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0981822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0741  Integrase catalytic region  54.55 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4622  Integrase catalytic region  54.55 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0989982  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  50 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1471  integrase catalytic subunit  50.98 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.394095  normal  0.129997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4080  Integrase catalytic region  54.55 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  50 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4235  Integrase catalytic region  54.55 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2029  hypothetical protein  62.22 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  51.79 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1895  Integrase catalytic region  54.55 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.571703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  51.79 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  50 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  50 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15130  transposase  46.88 
 
 		 304 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0124781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  47.37 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  47.37 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  47.37 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  48.15 
 
 		 296 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  48.15 
 
 		 296 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  48.15 
 
 		 296 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  48.15 
 
 		 295 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  48.15 
 
 		 296 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  50 
 
 		 278 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  49.12 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>