More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3256 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
236 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144706  hitchhiker  0.0000785935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.15 
 
 
213 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.543877  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 
223 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.96 
 
 
216 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.56 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  31.63 
 
 
213 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  31.63 
 
 
213 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  31.16 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  31.48 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.68 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.1 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  31.56 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  33.18 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7043  hypothetical protein  34.4 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284311  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.85 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.85 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 
217 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  29.91 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  27.7 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.73 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  25.65 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.49 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  31.53 
 
 
216 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.28 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  29.49 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975947  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.09 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.63 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 
212 aa  75.1  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.86 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.14 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  27.52 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7739  hypothetical protein  33.03 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.84 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.22 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  27.44 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.72 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  25.79 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  27.06 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  31.43 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.13 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  27.93 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  27.27 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.7 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  30.88 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.22 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.88 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  28.18 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.25 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0008  plasmid partition protein A, putative  25.94 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745248  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.25 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.25 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.8 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.8 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.84 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.84 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0032  putative plasmid partition protein A  25.47 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0137071  normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  27.01 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.9 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.32 
 
 
241 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.13 
 
 
215 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.19 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 
213 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.35 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.37 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.1 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.38 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.66 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.4 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.1 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.72 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.95 
 
 
217 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.93 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  27.67 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  27.91 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.93 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>