More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0906 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  100 
 
 		 288 aa  585  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  48.23 
 
 		 262 aa  215  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  46.34 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  46.34 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  46.54 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  46.64 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  47.09 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  42.91 
 
 		 256 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  46.19 
 
 		 198 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  49.27 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  47.57 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  44.8 
 
 		 199 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  38.2 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  45 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  45.11 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  45.29 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  41.94 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  41.94 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  41.94 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  41.94 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  41.53 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  41.1 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  44.44 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  43.98 
 
 		 342 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  47.29 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  41.13 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  41.13 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  40.73 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  40.73 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  37.11 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  43.12 
 
 		 322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  45.62 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  41.53 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  45.62 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  47.78 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  41.13 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  43.58 
 
 		 225 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  41.94 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  45.74 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  40.98 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  41.15 
 
 		 262 aa  181  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  41.53 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  45.25 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  37.11 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  40.57 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  41.27 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  39.15 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  42.34 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  43.44 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  44.24 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  41.6 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  44.39 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  44.84 
 
 		 325 aa  178  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  44.24 
 
 		 297 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  41.32 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  44.84 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  47.29 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  39.6 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  44.24 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  44.24 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  44.24 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  50.7 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  39.69 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  43.78 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  39.69 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  43.78 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  39.31 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  44.55 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  41.59 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  45.21 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  42.8 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  43.64 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  37.84 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  44.75 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  45.59 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  45.45 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  40.82 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  43.54 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  40.68 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  48.83 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  43.64 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  38.06 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  43.64 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  40.91 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  46 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  39.39 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  42.55 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  42.55 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  42.55 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  48.6 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  39.08 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  39.08 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  39.08 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  39.08 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  45.16 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  39.08 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  39.82 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  38.7 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  38.7 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  38.31 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>