More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0711 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0711  signal transduction protein  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.402319  normal  0.674474 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1207  signal transduction protein  99.06 
 
 
213 aa  427  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230194  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0112  signal transduction protein  97.18 
 
 
213 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0311515  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0777  signal transduction protein  70.89 
 
 
213 aa  329  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.413451  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0375  CBS domain-containing protein  62.14 
 
 
209 aa  290  1e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0304  signal transduction protein  29.27 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1519  CBS domain-containing protein  30.58 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.356805  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0400  signal transduction protein  31.4 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1218  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0435  signal transduction protein  31.4 
 
 
120 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.78008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  35.65 
 
 
262 aa  58.9  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  30.65 
 
 
300 aa  57.4  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.77 
 
 
486 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.92 
 
 
483 aa  56.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  31.09 
 
 
343 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  24.86 
 
 
229 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2061  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.31 
 
 
489 aa  55.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144949 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1203  signal transduction protein  31.03 
 
 
315 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.803351  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  35.25 
 
 
142 aa  54.7  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0472  signal transduction protein  28.33 
 
 
120 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  29.8 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  25.98 
 
 
138 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  27.35 
 
 
262 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 
150 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  26.02 
 
 
141 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 
688 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.11 
 
 
313 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  26.53 
 
 
150 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.85 
 
 
482 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.85 
 
 
482 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  28.57 
 
 
502 aa  52.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.67 
 
 
488 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 
266 aa  52.4  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.81 
 
 
507 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  26.09 
 
 
145 aa  52.4  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1620  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.17 
 
 
489 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3596  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
487 aa  52.4  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000202307  normal  0.660698 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.5 
 
 
494 aa  51.6  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.25 
 
 
504 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.93 
 
 
500 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3243  CBS domain containing protein  27.12 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100628  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  22.47 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02400  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
488 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00346378  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1160  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
488 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000565668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.12 
 
 
493 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2660  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.19 
 
 
488 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000716462  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02362  hypothetical protein  30.28 
 
 
488 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00275672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1169  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
488 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00303448  normal  0.0122291 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2704  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.19 
 
 
488 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139604  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2745  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.19 
 
 
488 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00565207  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0737a  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.18 
 
 
487 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  26.83 
 
 
492 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.97 
 
 
486 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0651  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.85 
 
 
485 aa  50.4  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2659  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
488 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000118294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  23.4 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2767  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.19 
 
 
488 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268112  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2876  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.19 
 
 
488 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112732  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2657  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
511 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000195261  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3732  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
503 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000579162  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2883  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
488 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  26.23 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.71 
 
 
489 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2792  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.28 
 
 
488 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  26.36 
 
 
489 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  29.1 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  26.61 
 
 
300 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  25.19 
 
 
404 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1913  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.04 
 
 
486 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3004  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  25.93 
 
 
488 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00999222  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  27.42 
 
 
136 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.89 
 
 
520 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.97 
 
 
490 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.31 
 
 
161 aa  49.7  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2164  CBS domain containing protein  23.57 
 
 
288 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.57 
 
 
520 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  24.79 
 
 
120 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  19.86 
 
 
428 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0737  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.49 
 
 
483 aa  49.3  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2729  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.44 
 
 
487 aa  49.7  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0179443  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07600  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.58 
 
 
498 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.194742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  27.64 
 
 
500 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.84 
 
 
489 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0409  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  26.85 
 
 
515 aa  48.9  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000774513  decreased coverage  0.00000719153 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  27.91 
 
 
139 aa  49.3  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1545  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.72 
 
 
496 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.308364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.18 
 
 
487 aa  48.5  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  26.85 
 
 
487 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1302  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  26.85 
 
 
487 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000015836  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  26.12 
 
 
309 aa  48.5  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
423 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01076  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  25.45 
 
 
487 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.19 
 
 
486 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1014  putative signal transduction protein with CBS domains  40.3 
 
 
162 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.137576 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.19 
 
 
486 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
423 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  24.29 
 
 
229 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.19 
 
 
486 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.19 
 
 
486 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.19 
 
 
486 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>