207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0681 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
232 aa  478  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  97.84 
 
 
232 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  98.28 
 
 
232 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  88.79 
 
 
234 aa  441  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  84.05 
 
 
236 aa  412  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  62.93 
 
 
232 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  61.64 
 
 
232 aa  315  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  51.97 
 
 
230 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  51.34 
 
 
238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  49.78 
 
 
231 aa  235  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  47.53 
 
 
230 aa  223  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  45.74 
 
 
232 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  44.64 
 
 
232 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  45.98 
 
 
227 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  44.39 
 
 
232 aa  215  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  44.64 
 
 
228 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  45.54 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  44.64 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  45.29 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  44.64 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  46.19 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  43.05 
 
 
234 aa  211  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  42.86 
 
 
259 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  43.3 
 
 
227 aa  208  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  42.86 
 
 
228 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  44.21 
 
 
233 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  43.81 
 
 
236 aa  191  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  43.81 
 
 
234 aa  190  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  43.11 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  42.04 
 
 
235 aa  189  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  42.22 
 
 
235 aa  179  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  39.11 
 
 
235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  27.08 
 
 
209 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  29.17 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  31.25 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  26.67 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  25.97 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  31.18 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  28.95 
 
 
212 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  25 
 
 
284 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  23.66 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  29.57 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  29.1 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  27.03 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  24.42 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  27.33 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  26.74 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  27.33 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  24.57 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  27.65 
 
 
271 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  28.49 
 
 
284 aa  52.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  30.21 
 
 
203 aa  52.8  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  29.17 
 
 
217 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  30.87 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  30.87 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  30.87 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  26.06 
 
 
276 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  30.65 
 
 
203 aa  51.6  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2008  urease accessory protein UreG  29.79 
 
 
206 aa  52  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  29.73 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0959  urease accessory protein UreG  29.7 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  33.11 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  29.57 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  26.42 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  27.47 
 
 
275 aa  50.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1089  urease accessory protein UreG  27.46 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  26.42 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  26.97 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  30 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0058  urease accessory protein UreG  25.65 
 
 
204 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418935  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  31.79 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  26.42 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  22.4 
 
 
226 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  26.97 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  23.5 
 
 
253 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3881  hydrogenase accessory protein HypB  24.86 
 
 
242 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.785177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  30.41 
 
 
204 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  26.85 
 
 
296 aa  48.5  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  25 
 
 
280 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  26.4 
 
 
293 aa  48.5  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  24.28 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1347  urease accessory protein UreG  29.73 
 
 
218 aa  48.5  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1364  urease accessory protein UreG  31.08 
 
 
210 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  26.97 
 
 
217 aa  48.5  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  28.49 
 
 
204 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2409  urease accessory protein UreG  25.52 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  26.99 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  26.54 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  29.52 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  26.4 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  31.08 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  27.42 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2484  hydrogenase accessory protein HypB  26.52 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1756  urease accessory protein UreG  29.23 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0086861  normal  0.860103 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1326  urease accessory protein UreG  32.91 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  30 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0971  urease accessory protein UreG  30.41 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  27.08 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1684  urease accessory protein UreG  26.04 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  31.08 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>