More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0225 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  658    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  94.12 
 
 		 324 aa  617  1e-176  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0175  PP-loop domain-containing protein  79.57 
 
 		 323 aa  531  1e-150  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  66.67 
 
 		 334 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  26.77 
 
 		 244 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  26.77 
 
 		 244 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  27.49 
 
 		 252 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  28.74 
 
 		 252 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20940  PP-loop domain protein  27.48 
 
 		 260 aa  86.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000433533  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  29.15 
 
 		 304 aa  86.7  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  24.9 
 
 		 247 aa  86.3  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  27.64 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  26.26 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  24.73 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  25.28 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0699  PP-loop family protein  27.63 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.966834  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  28.94 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  25.66 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  25.45 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  25.45 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  26.39 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  25.83 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  30.8 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  28.81 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  29.3 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  29 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0125  PP-loop family protein  25.46 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.658918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  26.26 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0206  conserved hypothetical protein, putative ATPase (PP-loop superfamily)  28.24 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  22.42 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  26.82 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  33.53 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1709  PP-loop domain protein  23.95 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  27.8 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  28 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  25.09 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2711  tRNA(Ile)-lysidine synthase  25.33 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.658001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  28 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0731  PP-loop domain protein  26.61 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0735  C32 tRNA thiolase  30.05 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  25.6 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  23.88 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0527  PP-loop domain protein  25.76 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1661  C32 tRNA thiolase  27.57 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  27.21 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1733  C32 tRNA thiolase  27.57 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  26.39 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  24.72 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  27.04 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0753  C32 tRNA thiolase  29.58 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  22.88 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2225  C32 tRNA thiolase  26.39 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.28353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03846  C32 tRNA thiolase  28.32 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0139  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.29 
 
 		 492 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00237598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  26.25 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  26.01 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003477  tRNA(Cytosine32)-2-thiocytidine synthetase  26.86 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0168289  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  23.88 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  27.34 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  27.38 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  25.58 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4142  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  23.62 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02293  C32 tRNA thiolase  26.29 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  28.84 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  27.38 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  27.38 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  27.75 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  27.98 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3082  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.9 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  27.59 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  27.73 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1167  C32 tRNA thiolase  27.8 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.958339  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  28.57 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.38 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  27.01 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.1 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.58 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  25 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  27.01 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  27.01 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  26.02 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  30.86 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2181  ATPase  26.17 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000263465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  24.04 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  27.17 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  23.88 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1817  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  22.11 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19753  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  21.54 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  24.04 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0868  C32 tRNA thiolase  28.43 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  27.75 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  27.43 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  27.12 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>