38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1868 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
335 aa  666    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.65 
 
 
324 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2626  hypothetical protein  30.61 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.1 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.65 
 
 
358 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.35 
 
 
373 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
356 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.13 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.54 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.54 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  21.07 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.27 
 
 
323 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.24 
 
 
335 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  24.48 
 
 
304 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  25.32 
 
 
359 aa  49.7  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  23.37 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.5 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  31.82 
 
 
320 aa  47  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 
326 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.47 
 
 
331 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.88 
 
 
323 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.31 
 
 
293 aa  46.2  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.78 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.3 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  26.54 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.01 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.88 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  27.78 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.75 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.34 
 
 
354 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.49 
 
 
353 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  25.69 
 
 
308 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2934  hypothetical protein  24.11 
 
 
285 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.195363  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.74 
 
 
300 aa  42.4  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>