36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1688 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  100 
 
 		 421 aa  819    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  41.51 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  39.03 
 
 		 419 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  32.07 
 
 		 433 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  33.42 
 
 		 438 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  32.13 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  32.52 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  30.48 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  32.43 
 
 		 409 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  28.49 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  26.53 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  29.27 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  28.21 
 
 		 313 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  30.26 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  27.87 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  28.51 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  27.95 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  28.42 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  25.85 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  26.69 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  26.69 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  32.29 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  27.7 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  25.14 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  33.18 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  31.63 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  29.07 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  34.36 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  31.7 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  26.84 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  25.91 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  28.07 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  26.2 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  32.08 
 
 		 358 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  24.56 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>