117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0457 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  741    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  52.66 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  50.56 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  50.42 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  46.65 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  34.64 
 
 		 391 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  32.67 
 
 		 355 aa  150  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  31.34 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  27.3 
 
 		 414 aa  92  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  24.72 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  25.42 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  25.07 
 
 		 349 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  24.3 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  27.95 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  25.77 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  30.04 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  25.89 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  26.5 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  29.26 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  23.08 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.81 
 
 		 1059 aa  58.9  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1395  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.19 
 
 		 1087 aa  57  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.943513  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1692  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.91 
 
 		 1089 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  23.64 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  23.68 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.28 
 
 		 1063 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  21.27 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0949  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.97 
 
 		 1072 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.742849  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1302  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.99 
 
 		 1082 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  25.13 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0261  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.99 
 
 		 1064 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.81 
 
 		 1062 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.22 
 
 		 1071 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0327  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.22 
 
 		 1089 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0305  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.57 
 
 		 1089 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4016  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.77 
 
 		 1065 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.78 
 
 		 1065 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  26.04 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3713  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.62 
 
 		 1072 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3577  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.91 
 
 		 1072 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.108884 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3628  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.19 
 
 		 1072 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2535  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.5 
 
 		 1072 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.900385  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.07 
 
 		 1057 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.52 
 
 		 1065 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3737  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.19 
 
 		 1072 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3645  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.19 
 
 		 1072 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4025  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.19 
 
 		 1072 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  31.31 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  25.45 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3935  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.19 
 
 		 1072 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.144651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3984  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.19 
 
 		 1072 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3900  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.19 
 
 		 1072 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000425405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  26.29 
 
 		 295 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1370  carbamoyl-phosphate synthase large chain  23.28 
 
 		 1073 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636117  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1430  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.28 
 
 		 1073 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1281  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.53 
 
 		 1074 aa  49.7  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  28.28 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0870  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.67 
 
 		 1087 aa  49.7  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3931  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.85 
 
 		 1072 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  31.86 
 
 		 319 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  28.28 
 
 		 302 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2914  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.74 
 
 		 1070 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1257  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.19 
 
 		 1072 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1467  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.01 
 
 		 1085 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0319  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.44 
 
 		 1084 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.74 
 
 		 1057 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.74 
 
 		 1057 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  23.56 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2127  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.61 
 
 		 1086 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3403  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.23 
 
 		 1072 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000056188 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.16 
 
 		 1496 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  21.32 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1541  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.96 
 
 		 1077 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  26.97 
 
 		 307 aa  47.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1868  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.83 
 
 		 1067 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0541  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.52 
 
 		 1066 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.55 
 
 		 1059 aa  47  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0616  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.82 
 
 		 1071 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  24.35 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2503  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.9 
 
 		 1076 aa  46.6  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.19 
 
 		 1072 aa  46.6  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.78 
 
 		 1079 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0363  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.29 
 
 		 1099 aa  46.2  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.948928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0060  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.31 
 
 		 1065 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2669  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.35 
 
 		 1069 aa  46.2  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1378  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.61 
 
 		 1075 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  23.01 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3085  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.89 
 
 		 1076 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0560  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.5 
 
 		 1079 aa  45.8  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1477  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.35 
 
 		 1054 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.438417  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.47 
 
 		 1064 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3074  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.9 
 
 		 1073 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  26.26 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0380  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.03 
 
 		 1099 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2319  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.4 
 
 		 1056 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.78 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  25.1 
 
 		 1147 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1350  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.55 
 
 		 1086 aa  44.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.501423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0714  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.23 
 
 		 1074 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.278068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  22.45 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>