60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0268 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 301 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  52.35 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  54.03 
 
 		 295 aa  312  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  52.15 
 
 		 299 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  51.01 
 
 		 295 aa  286  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  35.02 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  35.55 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  35.58 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  30.98 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  30.3 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  30.95 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  27.18 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  26.3 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  28.7 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  27.82 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  24.58 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  25.21 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  25.78 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  26.89 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  25.47 
 
 		 349 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  25 
 
 		 366 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  28.82 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  28 
 
 		 357 aa  52.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  24.53 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  26.04 
 
 		 357 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  28.57 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  27.8 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.2 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.56 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.56 
 
 		 393 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.56 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2478  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  28 
 
 		 400 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00049074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29 
 
 		 393 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3406  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  30 
 
 		 393 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630931  normal  0.629093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4162  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.92 
 
 		 393 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  21.89 
 
 		 347 aa  46.2  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  26.03 
 
 		 318 aa  45.8  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39610  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.72 
 
 		 393 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.55 
 
 		 400 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.89 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1277  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29 
 
 		 393 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1014  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4380  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.26 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5252  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.53 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426519  normal  0.758547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.49 
 
 		 395 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.881865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  24.75 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1367  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  32.5 
 
 		 393 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  27.6 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15890  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  32.5 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.17999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0360  D-alanine/D-alanine ligase  27.5 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  32.12 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.94 
 
 		 402 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.59 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  26.96 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  26.96 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  25.08 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  23.42 
 
 		 414 aa  43.1  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0850  D-alanine--D-alanine ligase  23.63 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.868675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  25.24 
 
 		 396 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  26.47 
 
 		 304 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>