64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0121 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0121  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  224  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  62.96 
 
 
112 aa  148  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0306  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.64 
 
 
114 aa  135  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.739579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0078  carboxymuconolactone decarboxylase  61.39 
 
 
135 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0163  carboxymuconolactone decarboxylase  58 
 
 
116 aa  117  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0332  carboxymuconolactone decarboxylase  33.72 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.711458  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0476  carboxymuconolactone decarboxylase  35.87 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.311058  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0431  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0404  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482016  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1515  carboxymuconolactone decarboxylase  35.35 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  27.93 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  29.03 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2518  carboxymuconolactone decarboxylase  26.37 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.541729  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
132 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  29.49 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  31.82 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2858  carboxymuconolactone decarboxylase  35.21 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  24.56 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2880  carboxymuconolactone decarboxylase  35.21 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.15675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1895  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.53 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00163146  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2589  carboxymuconolactone decarboxylase  35.21 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.058576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5222  Carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  31.51 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.27 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2835  carboxymuconolactone decarboxylase  33.8 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2829  carboxymuconolactone decarboxylase  33.8 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.571755  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2554  carboxymuconolactone decarboxylase  33.8 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2638  carboxymuconolactone decarboxylase  33.8 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.41 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2841  carboxymuconolactone decarboxylase  33.8 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.307767  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  27.78 
 
 
116 aa  43.5  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2452  carboxymuconolactone decarboxylase  33.8 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2632  alkylhydroperoxidase  33.8 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  29.07 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.74 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.25 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  29.33 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.74 
 
 
110 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.58 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  26.44 
 
 
113 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.94 
 
 
119 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  26.88 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1090  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.24 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.93 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  29.33 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  26.58 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  29.76 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  30.67 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.67 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.67 
 
 
392 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.67 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3172  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.24 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  26.74 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.24 
 
 
134 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>