50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4486 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  278  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  57.14 
 
 		 145 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  57.39 
 
 		 145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  53.1 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.67 
 
 		 136 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4585  hypothetical protein  56.36 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.74 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.37 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  29.81 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5303  hypothetical protein  51.11 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 148 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  30.63 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  34.48 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  40.74 
 
 		 318 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  40.74 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  35.8 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  35.9 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  35 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  29.29 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  27.27 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  32.14 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  35.53 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.24 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  26.05 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 260 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  35 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  34.12 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.94 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  34.44 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 		 149 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.68 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  36.51 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 128 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0831  hypothetical protein  32.88 
 
 		 130 aa  40  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668197  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  34.83 
 
 		 136 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>