241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4193 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4193  YceI family protein  100 
 
 
192 aa  381  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  44.58 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  39.89 
 
 
186 aa  124  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  40.88 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  35.8 
 
 
209 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  39.35 
 
 
180 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  35.29 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  35.76 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30.59 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  34.91 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  34.91 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  34.91 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  33.33 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  32.45 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  29.14 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  34.68 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  34.66 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  37.5 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  31.37 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  32.21 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  35.86 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  33.77 
 
 
219 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  32.22 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  31.76 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  31.18 
 
 
212 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  31.61 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  29.65 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  29.8 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  28.99 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  31.38 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  29.94 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  33.12 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  34.12 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  31.64 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  29.17 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  31.54 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  34.21 
 
 
181 aa  72  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  33.53 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  33.53 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  32.42 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4157  YceI family protein  33.14 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135809  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  30.18 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  31.46 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  29.59 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  31.07 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  30.57 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  28.42 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  30.2 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  33.93 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  26.95 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  31.41 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  30.51 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  31.79 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  27.81 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  30.23 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  27.96 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  29.78 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  28.19 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  30.67 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  28.26 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  34.39 
 
 
184 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  27.54 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  31.36 
 
 
197 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  30.43 
 
 
187 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  28.38 
 
 
174 aa  61.6  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  31.08 
 
 
204 aa  61.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  31.36 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  28.82 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  29.65 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  29.05 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  29.03 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  30.67 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  30.87 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  29.14 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  32.65 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  29.93 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  29.14 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  30.87 
 
 
177 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  28.19 
 
 
177 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  29.05 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  33.82 
 
 
198 aa  58.2  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  27.01 
 
 
179 aa  57.8  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  27.52 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  31.29 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2885  YceI family protein  27.96 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265419  normal  0.0897618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37090  hypothetical protein  36.75 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0651495  normal  0.0184068 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  31.76 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  27.22 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  31.25 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  31.97 
 
 
196 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  28.93 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  34.38 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  29.27 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  30.43 
 
 
175 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  27.97 
 
 
177 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  29.88 
 
 
192 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1264  YceI family protein  25.33 
 
 
173 aa  55.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  29.63 
 
 
191 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3033  YceI family protein  28.67 
 
 
224 aa  54.7  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  30.67 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>