More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1756 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1995  acyl-CoA synthetase  88.35 
 
 
541 aa  952    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1756  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
542 aa  1097    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317816  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1775  acyl-CoA synthetase  99.26 
 
 
542 aa  1088    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4349  acyl-CoA synthetase  88.54 
 
 
541 aa  942    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1822  acyl-CoA synthetase  99.26 
 
 
542 aa  1088    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591345  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1786  acyl-CoA synthetase  40.07 
 
 
549 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1833  acyl-CoA synthetase  40.07 
 
 
549 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.936288  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4335  acyl-CoA synthetase  40.08 
 
 
550 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0901424  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2010  acyl-CoA synthetase  39.69 
 
 
550 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0691  AMP-dependent synthetase and ligase  40.98 
 
 
553 aa  360  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1767  acyl-CoA synthetase  39.47 
 
 
549 aa  356  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.848326  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2891  acyl-CoA synthetase  37.76 
 
 
558 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2921  acyl-CoA synthetase  37.76 
 
 
558 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2935  acyl-CoA synthetase  37.76 
 
 
558 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444954  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4748  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 
528 aa  306  7e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13548  acyl-CoA synthetase  36.94 
 
 
548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.89294e-46  hitchhiker  0.000000367112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4627  acyl-CoA synthetase  35.27 
 
 
549 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4715  acyl-CoA synthetase  35.27 
 
 
549 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3496  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 
544 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38244  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2248  acyl-CoA synthetase  37.45 
 
 
550 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5009  acyl-CoA synthetase  35.27 
 
 
549 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138056  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5215  acyl-CoA synthetase  36.11 
 
 
549 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3980  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 
526 aa  299  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1543  acyl-CoA synthetase  36 
 
 
549 aa  296  7e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0888  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 
545 aa  292  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1485  CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  37.66 
 
 
528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2174  acyl-CoA synthetase  35.1 
 
 
540 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264892  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2206  acyl-CoA synthetase  34.75 
 
 
536 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0886048  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 
557 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597937  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5298  acyl-CoA synthetase  33.09 
 
 
536 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2836  acyl-CoA synthetase  35.04 
 
 
539 aa  266  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3959  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 
547 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
545 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.172383  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1759  acyl-CoA synthetase  32.6 
 
 
536 aa  253  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2639  acyl-CoA synthetase  34.31 
 
 
540 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.981359  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2725  acyl-CoA synthetase  33.21 
 
 
548 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105793  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1531  acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 
531 aa  233  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1563  acyl-CoA synthetase  33.15 
 
 
531 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0290  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 
605 aa  229  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000671199  hitchhiker  0.000133038 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1806  AMP-dependent synthetase and ligase  28.47 
 
 
526 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 
508 aa  147  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  30.08 
 
 
564 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 
527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 
577 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 
506 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  26.89 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 
501 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.31 
 
 
519 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2967  feruloyl-CoA synthetase  28.63 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3343  feruloyl-CoA synthetase  28.63 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4030  feruloyl-CoA synthetase  28.63 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3028  feruloyl-CoA synthetase  28.63 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3956  feruloyl-CoA synthetase  28.63 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1574  feruloyl-CoA synthetase  28.63 
 
 
515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 
524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0163  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.63 
 
 
515 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  25.38 
 
 
528 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 
502 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 
509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.92 
 
 
509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13546  fatty-acid-CoA ligase fadD18  42.86 
 
 
218 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.46199e-133  hitchhiker  0.000000428617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  26.19 
 
 
525 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 
493 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 
514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 
502 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  29.14 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  26.7 
 
 
520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  23.52 
 
 
499 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  26.68 
 
 
534 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 
530 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  23.46 
 
 
500 aa  126  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 
510 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0727  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.98 
 
 
568 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.538259 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  26.85 
 
 
520 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  23.65 
 
 
500 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 
530 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  23.62 
 
 
500 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 
535 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 
517 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5034  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.3 
 
 
565 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.69733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.12 
 
 
525 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.68 
 
 
524 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  26.2 
 
 
523 aa  124  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  27.92 
 
 
503 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 
536 aa  124  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  25.38 
 
 
520 aa  124  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
502 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
502 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 
504 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0797  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.23 
 
 
568 aa  123  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.058688  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  23.65 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  25.78 
 
 
518 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.72 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  28.94 
 
 
504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2902  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 
523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.475075  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 
537 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 
502 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 
575 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.918334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2329  AMP-dependent synthetase and ligase  26.87 
 
 
521 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.247287  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  29.92 
 
 
503 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.714201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>